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扩增一个基因
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/BT017850 链接里的这个基因是blast出来的,但是引物设计了多次了,都没有扩出来,不知道是怎么回事,是不是这段序列本身就是错误的呢? 求高人指点,小弟不胜感激。 |
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yangjianchen
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【答案】应助回帖
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1949stone: 回帖置顶 2013-07-16 08:14:11
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1949stone: 回帖置顶 2013-07-16 08:14:11
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序列不会是错误的,可能您的序列和链接中的序列有些差异,但一般库里公布的序列是没有问题的,因此建议您从模板,引物,PCR反应体系上找原因:1模板的质量,最好扩增之前跑一下模板,对模板的质量包括浓度和纯度有个大概了解。 2引物设计是否合理,包括GC含量,TM值等,一般GC含量在40-60%,TM在55-65度比较好,2个引物的TM值还不能差异太大,另外还要注意设计引物注意避开发夹结构,二聚体,碱基错配等。 3 PCR体系一般不会有问题,模板质量不好多加一些,质量好稀释少加些。 4 退火温度梯度实验。 |
4楼2013-07-15 15:50:52













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