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银虫 (小有名气)

[求助] 在gromacs模拟中,配体小分子中苯环连的Br原子与苯环不在一个平面上

用gromacs对蛋白和配体小分子进行模拟,小分子配体的参数是通过 PRODRG Server 得到,但在模拟过程中发现小分子的构像不合理,苯环上的Br原子与苯环不在一个平面上,而且对构象进行能量最小化,仍存在这个问题,不知道大家是不是也遇到过这方面的问题,希望帮忙解答!
在gromacs模拟中,配体小分子中苯环连的Br原子与苯环不在一个平面上
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huyingdamon

银虫 (小有名气)


同学我想请教您一下,问问题时您下面这个图片怎么粘上去的呢,我有些问题表达不清楚,希望能向您一样附加图片上去,就很明了了
谢谢哈 你的问题我帮不了
2楼2013-07-12 12:41:34
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