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469187892银虫 (小有名气)
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在gromacs模拟中，配体小分子中苯环连的Br原子与苯环不在一个平面上
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用gromacs对蛋白和配体小分子进行模拟，小分子配体的参数是通过 PRODRG Server 得到，但在模拟过程中发现小分子的构像不合理，苯环上的Br原子与苯环不在一个平面上，而且对构象进行能量最小化，仍存在这个问题，不知道大家是不是也遇到过这方面的问题，希望帮忙解答!  ligand.png |
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