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【有奖讨论】分子间氢键和分子内氢键的界定（优先奖励前10名）
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在一个晶体结构中，有一个分子是包含正负离子的， 那么正负离子间的氢键是分子间氢键还是分子内氢键？ 如果一个晶胞中本来就有两个分子，而不是经对称性操作转化出来的，这两分子之间的氢键作用是分子内还是分子间氢键？ 例如一个化合物的不对称单元图中包含两个有机铵离子，一个硫酸根离子和两个水分子，那么你认为以下氢键中，哪个是分子内（intramolecular）氢键，哪个是分子间（intermolecular）氢键？ 1. 有机铵离子和硫酸根之间的 N-H...O 2. 有机铵离子和水分子之间的 N-H...O 3. 水分子间和硫酸根之间的O-H...O [ Last edited by lingzi326 on 2007-10-28 at 15:18 ] |
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brilliant
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seasedoctor(金币+1,VIP+0):谢谢。
lingzi326(金币+2,VIP+0):谢谢，正负离子间的氢键作用是分子内还是分子间氢键呢？
seasedoctor(金币+1,VIP+0):谢谢。
lingzi326(金币+2,VIP+0):谢谢，正负离子间的氢键作用是分子内还是分子间氢键呢？
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用platon 计算一下，确认氢键存在，从晶体学来说，若是一个晶胞中的两个分子,那应该是分子间氢键作用。而分子内氢键，为一个分子的X-H键与其内部的Y原子产生的氢键，如邻位硝基苯酚中就存在着分子内氢键。分子内氢键必须具各形成氢键的必要条件，还要具有特定的条件，如形成平面环，环的大小以五或六原子环最稳定，形成的环中没有任何的扭曲。 [ Last edited by brilliant on 2007-10-28 at 18:02 ] |
4楼2007-10-28 17:08:49
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stevenabing
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lingzi326(金币+4,VIP+0):非常感谢，你准确回答了问题的疑点，还顺便提到了platon中的bug。如果遇到有关于这方面的文献，欢迎上传来佐证这个观点。
lingzi326(金币+4,VIP+0):非常感谢，你准确回答了问题的疑点，还顺便提到了platon中的bug。如果遇到有关于这方面的文献，欢迎上传来佐证这个观点。
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你的这个问题很有意思。其实，问题出在晶体学中的分子和我们化学中说的分子中有些差别。晶体中看的是不对称单元，而化学中说的是一个化学实体（暂且这样叫）。大部分情况下，二者是一致的，但是有时却不一样，所以，会出现如你所诉的问题。我以前遇见这样的情况都是这样处理的，以我们化学中的为主，编辑都没有提出意见的。所以，你的问题可以这样回答，一个分子内正负离子间的氢键可以认为是分子内氢键，而同一晶胞中的不同分子，即使晶体学上没有经过对称得来的，它们之间的氢键一般认为是分子间氢键。 还有一点要指出，PLATON计算出来的结果，我们要仔细甄别，尤其是关于氢键部分。还有个人发现PLATON得到的对称代码和XP得到的不一致。 |
5楼2007-10-29 08:17:11