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【有奖讨论】分子间氢键和分子内氢键的界定(优先奖励前10名)
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在一个晶体结构中,有一个分子是包含正负离子的, 那么正负离子间的氢键是分子间氢键还是分子内氢键? 如果一个晶胞中本来就有两个分子,而不是经对称性操作转化出来的,这两分子之间的氢键作用是分子内还是分子间氢键? 例如一个化合物的不对称单元图中包含两个有机铵离子,一个硫酸根离子和两个水分子,那么你认为以下氢键中,哪个是分子内(intramolecular)氢键,哪个是分子间(intermolecular)氢键? 1. 有机铵离子和硫酸根之间的 N-H...O 2. 有机铵离子和水分子之间的 N-H...O 3. 水分子间和硫酸根之间的O-H...O [ Last edited by lingzi326 on 2007-10-28 at 15:18 ] |
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2楼2007-10-28 15:22:12
3楼2007-10-28 16:29:52
brilliant
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seasedoctor(金币+1,VIP+0):谢谢。
lingzi326(金币+2,VIP+0):谢谢,正负离子间的氢键作用是分子内还是分子间氢键呢?
seasedoctor(金币+1,VIP+0):谢谢。
lingzi326(金币+2,VIP+0):谢谢,正负离子间的氢键作用是分子内还是分子间氢键呢?
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用platon 计算一下,确认氢键存在,从晶体学来说,若是一个晶胞中的两个分子,那应该是分子间氢键作用。而分子内氢键,为一个分子的X-H键与其内部的Y原子产生的氢键,如邻位硝基苯酚中就存在着分子内氢键。分子内氢键必须具各形成氢键的必要条件,还要具有特定的条件,如形成平面环,环的大小以五或六原子环最稳定,形成的环中没有任何的扭曲。 [ Last edited by brilliant on 2007-10-28 at 18:02 ] |
4楼2007-10-28 17:08:49
stevenabing
至尊木虫 (正式写手)
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lingzi326(金币+4,VIP+0):非常感谢,你准确回答了问题的疑点,还顺便提到了platon中的bug。如果遇到有关于这方面的文献,欢迎上传来佐证这个观点。
lingzi326(金币+4,VIP+0):非常感谢,你准确回答了问题的疑点,还顺便提到了platon中的bug。如果遇到有关于这方面的文献,欢迎上传来佐证这个观点。
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你的这个问题很有意思。其实,问题出在晶体学中的分子和我们化学中说的分子中有些差别。晶体中看的是不对称单元,而化学中说的是一个化学实体(暂且这样叫)。大部分情况下,二者是一致的,但是有时却不一样,所以,会出现如你所诉的问题。我以前遇见这样的情况都是这样处理的,以我们化学中的为主,编辑都没有提出意见的。所以,你的问题可以这样回答,一个分子内正负离子间的氢键可以认为是分子内氢键,而同一晶胞中的不同分子,即使晶体学上没有经过对称得来的,它们之间的氢键一般认为是分子间氢键。 还有一点要指出,PLATON计算出来的结果,我们要仔细甄别,尤其是关于氢键部分。还有个人发现PLATON得到的对称代码和XP得到的不一致。 |
5楼2007-10-29 08:17:11
6楼2007-10-29 09:47:12

7楼2007-10-29 16:23:14
8楼2007-10-29 21:39:09
xw16831983
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9楼2007-10-30 23:48:11
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