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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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Leliel

铜虫 (初入文坛)

[求助] ngmx指令找不到

我是刚装好的gromacs4.6.2,最新版本,添加了bin里面的环境变量后发现其他的功能都可以使用(如pdb2gmx,genion,genbox等等),但是想用ngmx打开trr的时候发现错误:bash:no such command。
请问这是什么问题?该如何解决??

我已经在想着下一个VMD来看了= =

信息:CentOS6.3,新系统
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God‘s in his heaven,all's right with the world。
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huyingdamon

银虫 (小有名气)


同学,我的是windows,所以下了VMD,我试着导入trr文件,可是窗口没显示图形,是不是要设置什么,您知道吗,谢谢哈,关于您提问的我也不会,呵呵
2楼2013-07-09 13:22:54
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Leliel

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by huyingdamon at 2013-07-09 13:22:54
同学,我的是windows,所以下了VMD,我试着导入trr文件,可是窗口没显示图形,是不是要设置什么,您知道吗,谢谢哈,关于您提问的我也不会,呵呵

呃,我是用的linux下的vmd,昨天刚装上,不过现在在跑程序也没试着用过,我觉得你可以去vmd的官网找点manual来看
God‘s in his heaven,all's right with the world。
3楼2013-07-10 14:39:38
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liangjun44

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by huyingdamon at 2013-07-09 13:22:54
同学,我的是windows,所以下了VMD,我试着导入trr文件,可是窗口没显示图形,是不是要设置什么,您知道吗,谢谢哈,关于您提问的我也不会,呵呵

想要查看轨迹的话,先导入.gro文件,再在这个gro文件中load入trr文件。直接打开trr是什么都看不见的……建议看看vmd的手册吧
4楼2013-07-10 20:23:25
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liangjun44

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Leliel: 金币+20, ★★★很有帮助, 虽然我已经打算用vmd了,不过你的建议还是很中肯的!谢谢!! 2013-07-11 13:01:00
我以前试过这样的:在cygwin下面装gromacs,ngmx用不了,因为缺少Xwindows和Xorg什么的,这个可能有点关系,可以尝试装一下xwindows或者xorg,然后再编译重新gromacs
其实对比起vmd,ngmx确实是没多大用处,建议还是用vmd吧
5楼2013-07-10 20:28:35
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yaozhq

金虫 (小有名气)

其实你回头去看编译时候的记录就会看到 你肯定是系统缺少了什么库 gromacs认定没法编译出ngmx 而且ngmx也只是一个很简单的小工具 实际用途远不如vmd 它也就是提醒你一下 一闪而过 后面只是不去管ngmx了
6楼2013-07-11 20:46:42
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huyingdamon

银虫 (小有名气)


引用回帖:
4楼: Originally posted by liangjun44 at 2013-07-10 20:23:25
想要查看轨迹的话,先导入.gro文件,再在这个gro文件中load入trr文件。直接打开trr是什么都看不见的……建议看看vmd的手册吧...

嗯 谢谢哈
7楼2013-07-12 12:16:48
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