应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 氢键催化双分子Diels-Alder反应，应选用哪种基组和方法？
52/1返回列表
查看: 1732  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

schalke

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 氢键催化双分子Diels-Alder反应，应选用哪种基组和方法？

glu、tyr残基形成氢键催化双分子Diels-Alder反应，需要进行底物复合物几何优化与过渡态结构优化得到精确构型并计算反应活化能，整个体系有92个原子。请问哪种基组和方法比较合适呢？参考文献使用的是b3lyp 6-31G+(d,p)。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2013-07-09 09:32:41
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

亍寞

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by schalke at 2013-07-11 17:39:20
哎，一直用b3lyp，没用过ONIOM，我这就92个原子算是大体系？...

咱说的并不是你这个体系究竟有多大，可是你不是又担心精度低又担心时间长么
赞一下(1人) 回复此楼
11楼2013-07-12 08:16:22
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

xzz1007

金虫 (小有名气)
我之前算过DA反应，但也就二十几个原子，不超过三十，使用的是b3lyp/6-311G++(d,p)优化，mp2/6-311G++(d,p)计算的能量。
赞一下 回复此楼
阳光总在风雨后，再坚持坚持吧.....
2楼2013-07-09 13:41:32
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

亍寞

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
schalke: 金币+10, ★有帮助 2013-07-10 15:51:54
咱以前算过的时候用的是b3lyp 6-31G+(d) 记得当初单从结果上来看，没觉得有多大差别，嘛。。。不过如果计算条件好，不如一次到位。。。。。顺便麻烦lz说下参考文献的号？
赞一下 回复此楼
4楼2013-07-10 11:27:52
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

schalke

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xzz1007 at 2013-07-09 13:41:32
我之前算过DA反应，但也就二十几个原子，不超过三十，使用的是b3lyp/6-311G++(d,p)优化，mp2/6-311G++(d,p)计算的能量。

谢谢，很有帮助！我最近查文献，都说b3lyp 对弱相互作用计算很烂，我这种情况需要计算氢键结合稳定过渡态，是不是用m06-2x更好一些？但不知道时间上会不会太久？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
5楼2013-07-10 15:56:13
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 要骂人了，新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西，结果有个评委还在说凝练得不够 +6 瞬息宇宙 2026-08-31 12/600 2026-09-02 10:49 by 瞬息宇宙
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题，而不是去凝练问题 +4 瞬息宇宙 2026-09-01 8/400 2026-09-02 10:35 by 瞬息宇宙
[基金申请] 我不理解！ +16 Edward_pc 2026-08-26 24/1200 2026-09-02 10:32 by newfuzzy1
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗？ +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了，像什么等级？ 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +5 bjdxyxy 2026-08-26 5/250 2026-09-01 17:54 by 小伟大博士
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 国社科又开始会评了，不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 基金不中，共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭