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[交流]
通过质谱的质量位移确定分子式 已有1人参与
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| 各位大神 我现在做蛋白质的修饰，加入我通过质谱知道蛋白质某一个氨基酸侧链被修饰，而且通过通过计算知道了修饰的精确分子量，现在我要确定这个修饰的分子式。请问用什么软件来计算可能的分子式或者分子结构呢？ |
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 蛋白质生物学实验经验 |
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1949stone: 回帖置顶 2013-07-08 08:10:19
kx444555: 金币+5, 鼓励交流 2013-07-08 08:50:29
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1.Method in Enzymology Vol-402 Biological Mass Spectrometry(2005,)免费下载 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5795342 2.复杂样品的综合分析——剖析技术概论（对分析复杂未知样品非常有用啊） http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3670419 自己去看吧，我自己参加讨论蛋白质质谱分析的两个贴现在一时找不到了。 你要是想根据肽段的分子量搜索出未知蛋白质的名称、结构和可能的功能用MS-FIF,SALSA(Tandem MS),Sequest 等软件都可以，但是如果你想测定蛋白质的人为的修饰的有机小分子，而且数据库里没有这种修饰的蛋白质，那不是质谱数据库的问题，那要就和红外光谱，质谱，紫外光谱等人工解析出有机小分子的结构式了。参见：复杂样品的综合分析——剖析技术概论，解析有机小分子确定分子质量是第一步，而后结合红外光谱判定各个共价键的类型和排布，再接合上紫外光谱，基本上不能确定，因为分子量小。如果是结合上了有机高分子到蛋白质分子上，你还不知道结合的是什么，那建议用NMR测定吧。 下面两贴，参考一下： 3. 高分辨率质谱，如581.2131，582.2162，我可以推出分子式吗http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5676944 4. UV，IR，MS，NMR各自的原理以及各能提供哪些结构信息 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5524502 |
2楼2013-07-07 22:28:46
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