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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求助交流——提取茶叶DNA
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花雨sky

金虫 (小有名气)

[求助] 求助交流——提取茶叶DNA

初次做分子实验提取茶叶DNA，右边是随便找的一个marker，想问问各位大侠
1.电泳尾部一片亮是DNA降解吗，或者是RNA吗？
2. 我用的是改良的CTAB法提取的，冰上研磨，没有用液氮，这对DNA的降解产生的影响大吗？
3. 如果用SSR标记，跑PCR的时候，对跑出来的带影响大吗？
PS：茶叶中的多酚类物质含量较高
请各位大侠指导，感激不尽求助交流——提取茶叶DNA
[muchong.com][2134107]Image1.jpg

[ Last edited by 1949stone on 2013-7-4 at 10:42 ]
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    • 2013-07-04 10:24:15, 438.28 K

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1楼 2013-07-04 10:32:43
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武穆大成

木虫 (著名写手)

笨蛋

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
花雨sky: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-07-05 11:56:48
引用回帖:
3楼: Originally posted by 花雨sky at 2013-07-04 21:41:51
我想问下，从图中怎么看出来是DNA降解，RNA较多呢？我是用冰无水乙醇沉淀的，加入后并不能直接看到DNA沉淀（我做的成品茶和鲜叶中，只有茶树鲜叶加入乙醇后直接看到DNA）...

降解不是很严重，有涂抹条带，在2000一下的条带很亮，但是涂抹，，是rna降解的表现。。加rna酶处理会很好。。。可以用75%的乙醇的洗涤，洗两遍。。。
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4楼2013-07-05 11:40:50
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武穆大成

木虫 (著名写手)

笨蛋

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-04 11:39:50
花雨sky: 金币+10, ★有帮助 2013-07-05 10:01:04
明显降解。，且rna较多，可以改进：1，加入rna酶，，减少rna2，加巯基乙醇3，抽滤的步骤小心吸取上清。4，异丙醇加入轻柔搅起dna
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2楼2013-07-04 10:53:54
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花雨sky

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 武穆大成 at 2013-07-04 10:53:54
明显降解。，且rna较多，可以改进：1，加入rna酶，，减少rna2，加巯基乙醇3，抽滤的步骤小心吸取上清。4，异丙醇加入轻柔搅起dna

我想问下，从图中怎么看出来是DNA降解，RNA较多呢？我是用冰无水乙醇沉淀的，加入后并不能直接看到DNA沉淀（我做的成品茶和鲜叶中，只有茶树鲜叶加入乙醇后直接看到DNA）
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3楼2013-07-04 21:41:51
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花雨sky

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 武穆大成 at 2013-07-05 11:40:50
降解不是很严重，有涂抹条带，在2000一下的条带很亮，但是涂抹，，是rna降解的表现。。加rna酶处理会很好。。。可以用75%的乙醇的洗涤，洗两遍。。。...

嗯，十分感谢
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5楼2013-07-05 11:56:41
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