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youziyouzi

金虫 (小有名气)

[求助] 几何优化过程

我建立一个32个原子的超晶胞，并替换了3个原子做替位杂质并进行几何优化，但是优化特别慢，一整夜就只走了1步，而且走了几步后就不再继续算下去了。请问这是什么原因呢？我用的是八核的服务器，以前算32个原子的体系最多24小时也优化完毕了。
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1楼 2013-07-04 10:11:48
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infrared123

铁杆木虫 (著名写手)

To be excellent

【答案】应助回帖

★ ★
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franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-07-08 22:38:24
设置问题，VASP中INCAR参数要调整
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不要怕，不要悔
2楼2013-07-04 10:25:38
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未央于一

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
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youziyouzi(franch代发): 金币+4, 谢谢回帖交流，， 2013-07-09 13:26:07
是不是你选的参数精度太高了，你从低的算起，一点点往上加精度，看会不会好。还有就是你看在 properties里是不是选了声子谱或者拉曼什么的，那样会比较慢
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3楼2013-07-04 10:26:12
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小韧1

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-07-08 22:38:45
几何优化这么慢。你是不是参杂时把对称性取消了？要是P1，那就一个原子一个原子的算，自然就慢了
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生命之韧
4楼2013-07-04 10:41:15
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youziyouzi

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小韧1 at 2013-07-04 10:41:15
几何优化这么慢。你是不是参杂时把对称性取消了？要是P1，那就一个原子一个原子的算，自然就慢了

没有改过对称性的设置啊
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5楼2013-07-04 11:18:05
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youziyouzi

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 未央于一 at 2013-07-04 10:26:12
是不是你选的参数精度太高了，你从低的算起，一点点往上加精度，看会不会好。还有就是你看在 properties里是不是选了声子谱或者拉曼什么的，那样会比较慢

之前也用的同样的参数，优化没有这么慢啊
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6楼2013-07-04 11:19:26
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-07-08 22:39:02
franch: 金币+10, 谢谢回帖交流，， 2013-07-09 13:26:22
franch: 金币-10 2013-07-09 13:26:47
youziyouzi(franch代发): 金币+10, 谢谢回帖交流，， 2013-07-09 13:26:59
掺杂后进行结构优化时比未掺杂结构优化 慢很多
查看一下8核是不是真的都运行 有时候服务器显示分配了8核实际计算使用的并不是这么多
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7楼2013-07-04 12:32:58
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zrq319

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-07-08 22:39:10
youziyouzi(franch代发): 金币+3, 谢谢回帖交流，， 2013-07-09 13:27:16
有些时候计算的原子序数也影响计算的时间啊，不同的原子序数计算的时间肯定不一样，或者8个cpu你根本跑不动，你可以试着增加一下cpu试一试啊
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8楼2013-07-04 13:48:28
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hs0218

金虫 (正式写手)

DDr.

【答案】应助回帖

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youziyouzi(franch代发): 金币+3, 谢谢回帖交流，， 2013-07-09 13:27:27
top 检查下你cpu和内存占用率，如果这俩使用率低，说明你并行程序出了问题了，可能需要重新编译
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路漫漫其修远兮
9楼2013-07-04 15:39:04
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梦@君

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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引用回帖:
5楼: Originally posted by youziyouzi at 2013-07-04 11:18:05
没有改过对称性的设置啊...

make P1 后掺杂 对称性就改变了，你可以重新找下对称下 看下试试
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10楼2013-07-04 16:37:02
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