| 查看: 1008 | 回复: 2 | ||
tsadaye金虫 (初入文坛)
|
[求助]
dpd模拟data文件出错
|
|
我用ms的dpd模块建立的表面活性剂、水溶液模型，因为该模块不能输出car文件，所以我直接输出了msd文件，然后用里面的坐标手写data文件，不知道为什么运行时出现了 Unknown identifier in data file: 20249 0 3 12.6796 9.9493 21.4875 (../read_data.cpp:1549)的错误。我原子style定的是bond。data文件、in文件如下： data： LAMMPS 3d surfactant data file 20251 atoms 3038 bonds 0 angles 0 dihedrals 0 impropers 3 atom types 1 bond types 0 angle types 0 dihedral types 0 improper types 0.0000000E+00 15.00000 xlo xhi 0.0000000E+00 15.00000 ylo yhi 0.0000000E+00 30.00000 zlo zhi Masses 1 1.000000 2 1.000000 3 1.000000 Atoms 1 1 1 10.7537 12.0429 26.8374 2 2 1 1.6312 13.4848 7.3069 3 3 1 13.9371 14.8486 18.7519 4 4 1 10.1436 12.9190 29.5385 …… 20248 0 3 5.9272 11.4104 10.0652 20249 0 3 12.6796 9.9493 21.4875 20250 0 3 2.3158 4.0815 8.1375 20251 0 3 12.6128 6.2497 10.9017 Bonds 1 1 1 3039 2 1 2 3040 3 1 3 3041 …… 3035 1 3035 6073 3036 1 3036 6074 3037 1 3037 6075 3038 1 3038 6076 in文件： dimension 3 neighbor 2.0 bin neigh_modify delay 3 atom_style bond read_data data.micelle …… 程序到这就出错了，而且是提示第20248个原子出错，都是一样写的……求教原因，万分感谢 |
回复此楼» 猜你喜欢
化工专硕求调剂
已经有3人回复
-
274求调剂
已经有5人回复
-
调剂
已经有3人回复
-
08工学调剂
已经有15人回复
-
招08考数学
已经有16人回复
-
340求调剂
已经有3人回复
-
材料专硕找调剂
已经有4人回复
-
0854电子信息求调剂
已经有6人回复
-
0805 316求调剂
已经有4人回复
-
0854 考研调剂 招生了！AI 方向
已经有17人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Fluent读入已经计算完成的case&data文件出错
已经有10人回复
- 【求助】LAMMPS-运行报错
已经有9人回复
liuasia
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 102.6
- 散金: 200
- 帖子: 69
- 在线: 122.6小时
- 虫号: 3001880
- 注册: 2014-02-27
- 性别: GG
- 专业: 艺术美学
2楼2014-04-08 20:42:37
cahndengbin
新虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 208.1
- 红花: 2
- 帖子: 57
- 在线: 86.4小时
- 虫号: 2377020
- 注册: 2013-03-26
- 专业: 金属材料的力学行为
|
我认为是以下几行出现问题： 0 angle types 0 dihedral types 0 improper types data的说明里提到 “do not include a bond,angle, dihedral, improper type line if number of bonds,angles, etc is 0” 尝试下删去这三行，看看运行的结果。 PS： http://lammps.sandia.gov/doc/2001/data_format.html 里面有关于data文件的格式说明，请查看 |
3楼2016-12-29 10:42:54
