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lmcyjxs

金虫 (正式写手)

[求助] 大牛来指点下啊~CDS区到底含不含内含子?看了相关的帖反而把我搞糊涂了

各位大侠,我要崩溃了,不是说我没之前没看过帖,而是看了帖之后把我搞混了。
      1 CDS区到时含不含内含子?有一个老师说不含,一个说含,我看了论坛,两种说法我都好像看过。我认为是不含的。
      2 如果CDS区不含内含子,有些基因在NCBI里查到的,标题上注明是全长CDS区,但下面的注释里却显示含有很多个CDS区,基因序列也显示含有多个CDS区,如图1,难道CDS区真含有内含子才是正解?但为什么我克隆了一个基因,反转录得到的,不含内含子了,获得的基因就跟图1情况一样,终止密码子还更多,导致多个CDS区存在,怎么会这样呢?如图2
      3 若在一个基因序列里,含有多个CDS区(就是在多个不同位置含终止密码子),连接到表达载体是不是指翻译其识别的第一个CDS?
大牛来指点下啊~CDS区到底含不含内含子?看了相关的帖反而把我搞糊涂了
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大牛来指点下啊~CDS区到底含不含内含子?看了相关的帖反而把我搞糊涂了-1
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思路决定出路。。。
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lmcyjxs

金虫 (正式写手)

引用回帖:
26楼: Originally posted by 547star at 2013-06-23 10:18:20
估计是基因组没测定或者至少是没有对应的mRNA(虽然序列给出了,不是单独以mRNA存在,也有其他相似的mRNA但不同的碱基比较多),或者你选择项没设计好。
mRNA丰度不足会影响RT-PCR的。考虑到实验是普通的RT-PCR,可 ...

您好!谢谢您的耐心和热心帮助!我对第一个解决路线不是很理解,是反转录后,用特异性上游引物和Oligo(dT)引物来做PCR扩增,然后,将此RT-PCR产物克隆至克隆载体,测序初步表明是目的产物后再同时用特异性上游引物和下游引物,以T-载体和目的基因的重组质粒为模版扩增吗?以Oligo(dT)来做下游引物扩增的主要原理是怎样的啊?
    因为反转录的时候,已经有同时用到Oligo(dT)和Ramdom 6 mers引物了,理论上Oligo(dT)引物可以将mRNA调取出来,即反转录液里就算有DNA的污染,应该也会有cDNA存在而扩到不含内含子的CDS的,可是我的PCR产物里,只有含内含子的目的基因,在相应的位置上,不含内含子的CDS产物连个影都没有,我不是很理解。
   
思路决定出路。。。
27楼2013-06-23 10:57:38
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laoshi0633

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
lmcyjxs: 金币+1, 有帮助, 谢谢! 2013-06-14 17:10:09
您难道不知道特殊位置的TGA可以编码硒代半胱氨酸,Selenocysteine,
国内外很多人在研究这一课题
学习是一种信仰
2楼2013-06-14 16:27:25
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laoshi0633

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


lmcyjxs: 金币+1, 有帮助, 期待这位大牛继续多多指点,新手表示好好学习,天天向上~ 2013-06-14 17:11:26
1,你的认为是错误的。
2,基础知识有待积累
3,答案是可定的终止,除非你做特殊处理
学习是一种信仰
3楼2013-06-14 16:31:36
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lmcyjxs

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by laoshi0633 at 2013-06-14 16:27:25
您难道不知道特殊位置的TGA可以编码硒代半胱氨酸,Selenocysteine,
国内外很多人在研究这一课题

弱弱地惭愧地表示真不知道~会好好补充这一知识,谢谢。
思路决定出路。。。
4楼2013-06-14 17:07:52
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