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动感球球

木虫 (小有名气)

[求助] QM/MM和QMCF方法原理

本人是量子化学方面的新手,想请教一下大侠们,QM/MM和QMCF这两种方法的原理,它们与分子动力学模拟之间是什么关系?计算时所构建的模型最多能够容纳多少个原子,因为本人想要研究无机盐水溶的溶液结构性质,在浓度较低的条件下,体系中可能要包含几千的原子,请问这两种方法适用吗,会不会因为体系太大,程序跑不起来呢?
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空穴来风
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klaus1987

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 动感球球 at 2013-06-09 16:21:53
不好意思啊,弱弱的问一下体系里的一部分用原子用量子化学算,另外部分用分子动力学算如何能够实现呢,把所研究的体系直接分成两个部分吗,这样的计算结果能够反映出体系整体的性质吗?这样算有什么好处呢?...

确实是分成两步分的。我用的ms,具体的你要设定一部分原子作量子计算,其余部分就是分子力学算了。
7楼2013-06-11 13:31:59
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klaus1987

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
动感球球: 金币+5, 有帮助, 谢谢您的回复!O(∩_∩)O~ 2013-06-09 16:17:53
gmy1990: 金币+2 2013-06-11 01:34:57
我随便说说,以前用过QM/MM,就是体系里一部分原子用量子化学(QM)算,另外的用分子力学(MM)处理。容纳的结构肯定比分子动力学少,具体能否计算取决于你的计算机,和量子化学范围的大小。
2楼2013-06-09 09:38:49
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stalart

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
动感球球: 金币+5, 有帮助, 谢谢您的回复!O(∩_∩)O~ 2013-06-09 16:18:09
看看12年的这本书 Combining Quantum Mechanics and Molecular Mechanics, Vol 59 (0123808987)

你的机器够大就不要担心原子的个数. 分区算而已
3楼2013-06-09 09:54:30
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动感球球

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by klaus1987 at 2013-06-09 09:38:49
我随便说说,以前用过QM/MM,就是体系里一部分原子用量子化学(QM)算,另外的用分子力学(MM)处理。容纳的结构肯定比分子动力学少,具体能否计算取决于你的计算机,和量子化学范围的大小。

不好意思啊,弱弱的问一下体系里的一部分用原子用量子化学算,另外部分用分子动力学算如何能够实现呢,把所研究的体系直接分成两个部分吗,这样的计算结果能够反映出体系整体的性质吗?这样算有什么好处呢?
空穴来风
4楼2013-06-09 16:21:53
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