24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 1815  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

mengsk

金虫 (著名写手)

[求助] gromacs继续算,想保存当前的速度信息

gromacs跑MD,一开始设定跑10 ns,停下来之后如果想接着再跑10 ns,想保留10 ns处的速度信息,是不是只需把mdp文件里的gen_vel参数改为no就行了?
回复此楼

» 猜你喜欢

奋斗中的小木虫
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengsk

金虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by spirte雷 at 2013-06-14 09:27:20
gromacs有续跑的命令,是直接从你要你上一个时间开始,续跑完将续跑的和之前的合并就可以了。没太明白你说的保留10ns处的速度?……

如何合并?可以直接用cat命令把traj_1.xtc和traj_2.xtc合起来吗?
奋斗中的小木虫
8楼2013-06-23 11:56:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

spirte雷

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-06-14 09:56:14
jiaoyixiong: 应助指数+1 2013-06-14 09:56:57
gromacs有续跑的命令,是直接从你要你上一个时间开始,续跑完将续跑的和之前的合并就可以了。没太明白你说的保留10ns处的速度?……
用心体验就好
2楼2013-06-14 09:27:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengsk

金虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by spirte雷 at 2013-06-14 09:27:20
gromacs有续跑的命令,是直接从你要你上一个时间开始,续跑完将续跑的和之前的合并就可以了。没太明白你说的保留10ns处的速度?……

那你继续跑的时候,速度是沿袭上一步的速度,还是重新速度分布?
奋斗中的小木虫
3楼2013-06-14 09:50:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spirte雷

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by mengsk at 2013-06-14 09:50:11
那你继续跑的时候,速度是沿袭上一步的速度,还是重新速度分布?...

延续上一步的速度
用心体验就好
4楼2013-06-14 14:40:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085400电子信息类(川大控制工程)求调剂可跨专业 求老师联系 +4 626776879 2026-04-08 4/200 2026-04-14 14:49 by htcscq
[考研] 考研调剂 +13 长弓傲 2026-04-13 14/700 2026-04-14 14:44 by zs92450
[考研] 求助调剂,跨调 +17 X十甫寸Y 2026-04-11 18/900 2026-04-14 12:59 by fqwang
[考研] 0856专硕求调剂 希望是a区院校 +24 好好休息好不好 2026-04-09 27/1350 2026-04-13 22:22 by pies112
[考研] 302求调剂 +10 易!? 2026-04-13 10/500 2026-04-13 19:04 by lbsjt
[考研] 272分材料子求调剂 +41 Loy0361 2026-04-10 53/2650 2026-04-13 14:20 by 张zhihao
[考研] 考研二轮调剂 +10 故人?? 2026-04-09 10/500 2026-04-13 09:55 by szhize
[考研] 339求调剂 +8 hanwudada 2026-04-11 9/450 2026-04-12 15:36 by laoshidan
[考研] 0854调剂 +12 长弓傲 2026-04-09 13/650 2026-04-12 09:56 by 逆水乘风
[考研] 0860004 求调剂 309分 +9 Yin DY 2026-04-08 9/450 2026-04-11 22:55 by dongdian1
[考研] 本人女孩 +7 吼吼, 2026-04-10 9/450 2026-04-11 14:45 by ACS Nano——
[考研] 调剂 +4 电气300求调剂不 2026-04-08 7/350 2026-04-11 10:44 by 紫曦紫棋
[考研] 087100初试311求调剂 +4 任雅琴 2026-04-09 4/200 2026-04-11 10:33 by zhq0425
[考研] 085410-273求调剂 +6 X1999 2026-04-10 6/300 2026-04-11 10:32 by Delta2012
[考研] 0854调剂 +4 长弓傲 2026-04-09 4/200 2026-04-11 09:18 by 猪会飞
[考研] 一志愿211,化学310分,本科重点双非,求调剂 +23 努力奋斗112 2026-04-08 23/1150 2026-04-10 23:29 by 314126402
[考研] 344求调剂 +7 丶风雪夜归人丶 2026-04-09 7/350 2026-04-10 12:05 by pengliang8036
[考研] 求调剂 +3 猪肉墩粉条cc 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:05 by 猪肉墩粉条cc
[考研] 机械专硕273请求调剂 +6 庚申壬申 2026-04-07 6/300 2026-04-08 22:41 by bljnqdcc
[考研] 275 求调剂 +8 Lei812514 2026-04-07 8/400 2026-04-08 12:46 by chemisry
信息提示
请填处理意见