24小时热门版块排行榜    

查看: 1728  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

mengsk

金虫 (著名写手)

[求助] gromacs继续算,想保存当前的速度信息

gromacs跑MD,一开始设定跑10 ns,停下来之后如果想接着再跑10 ns,想保留10 ns处的速度信息,是不是只需把mdp文件里的gen_vel参数改为no就行了?
回复此楼

» 猜你喜欢

奋斗中的小木虫
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengsk

金虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by spirte雷 at 2013-06-14 14:40:58
延续上一步的速度...

那mdp文件里需不需要修改什么参数?如gen_vel是yes 还是 no ?
奋斗中的小木虫
5楼2013-06-15 10:19:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

spirte雷

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-06-14 09:56:14
jiaoyixiong: 应助指数+1 2013-06-14 09:56:57
gromacs有续跑的命令,是直接从你要你上一个时间开始,续跑完将续跑的和之前的合并就可以了。没太明白你说的保留10ns处的速度?……
用心体验就好
2楼2013-06-14 09:27:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengsk

金虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by spirte雷 at 2013-06-14 09:27:20
gromacs有续跑的命令,是直接从你要你上一个时间开始,续跑完将续跑的和之前的合并就可以了。没太明白你说的保留10ns处的速度?……

那你继续跑的时候,速度是沿袭上一步的速度,还是重新速度分布?
奋斗中的小木虫
3楼2013-06-14 09:50:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spirte雷

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by mengsk at 2013-06-14 09:50:11
那你继续跑的时候,速度是沿袭上一步的速度,还是重新速度分布?...

延续上一步的速度
用心体验就好
4楼2013-06-14 14:40:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿上海交大生物与医药专硕324分,求调剂 +4 jiajunX 2026-03-22 4/200 2026-03-23 14:21 by xiaotangjing
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-21 3/150 2026-03-23 10:32 by Iveryant
[考研] 070300化学求调剂 +5 苑豆豆 2026-03-20 5/250 2026-03-23 09:39 by guoliang1816
[考研] 291求调剂 +5 孅華 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:20 by haoshis
[考研] 一志愿中南大学化学学硕0703总分337求调剂 +4 niko- 2026-03-22 4/200 2026-03-23 07:56 by Iveryant
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
[考研] 354求调剂 +7 Tyoumou 2026-03-18 10/500 2026-03-22 11:11 by 人来盛
[考研] 考研调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 材料工程专硕 348分求调剂 +3 冬辞. 2026-03-17 5/250 2026-03-21 18:47 by 学员8dgXkO
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
[考研] 279求调剂 +5 红衣隐官 2026-03-21 5/250 2026-03-21 14:59 by lature00
[考研] 二本跨考郑大材料306英一数二 +3 z1z2z3879 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:29 by JourneyLucky
[考研] 265求调剂 +9 梁梁校校 2026-03-17 9/450 2026-03-21 02:17 by JourneyLucky
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:32 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +9 Doleres 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:36 by JourneyLucky
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +22 rare12345 2026-03-18 22/1100 2026-03-20 20:39 by zhukairuo
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工调剂 324分 +10 llllkkkhh 2026-03-18 12/600 2026-03-19 14:33 by llllkkkhh
信息提示
请填处理意见