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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 关于NICS（核独立化学位移）zz值计算的问题
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一首琴歌

木虫 (小有名气)

[求助] 关于NICS（核独立化学位移）zz值计算的问题

恳请各位大侠指导：
请问如果要得到NICSzz的值，就必须把分子至于某一个平面（xy,xz,yz)内吗？任意平面可不可行？如果至于任意平面如何得到zz值？（比如下面的情形）
  29  Bq   Isotropic =     9.0958   Anisotropy =    24.9554
   XX=    10.5172   YX=     2.0685   ZX=     0.4430
   XY=     1.9615   YY=    24.9704   ZY=     3.8838
   XZ=     0.3711   YZ=     4.2081   ZZ=    -8.2002
如果必须要至于某一平面（xy,xz,yz)，是否有软件可以将所有坐标自动转换成在一特定的平面内？

By the way, 本人用gaussian做的计算。
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让我们忠于理想，让我们面对现实
1楼 2013-06-04 08:36:25
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+5 2013-06-04 16:48:33
一首琴歌: 金币+50, ★★★很有帮助, 很感谢您的答案，待我今天试一试 ^^ 2013-06-05 01:23:11
一首琴歌: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 经实践确实很棒！还有几个小小的问题，gaussian NMR计算给出的shielding里的xx, xy, xz...这些数值是以什么形式给出的？是以举证的形式吗 2013-06-09 12:57:33
可以置于任意平面。但是此时想得到NICS_ZZ值显然就不能直接看输出的ZZ数据。Multiwfn专门提供了解决对于环不处在笛卡尔平面或者环不是严格的平面的情况下获得NICS(0)_ZZ及NICS(1)_ZZ的功能。此功能是主功能100里的选项24，见Multiwfn手册3.100.24节的说明。
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2楼2013-06-04 16:46:41
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一首琴歌

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2013-06-04 03:46:41
可以置于任意平面。但是此时想得到NICS_ZZ值显然就不能直接看输出的ZZ数据。Multiwfn专门提供了解决对于环不处在笛卡尔平面或者环不是严格的平面的情况下获得NICS(0)_ZZ及NICS(1)_ZZ的功能。此功能是主功能100里的选 ...

额，错按了回车，还没问完
其中的如果xx是沿x方向的shiedling，那么xy,xz的物理意义又是啥？
在用multiwfn寻找非平面的NICS（1）zz时，需要用三个点定义一个平面来近似的描述需要计算的环。那么这三个点的选择有没有什么好的标准呢？还是属于“仁者见仁智者见智”了？
感谢大侠的解答！
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3楼2013-06-09 13:05:58
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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3楼: Originally posted by 一首琴歌 at 2013-06-09 13:05:58
额，错按了回车，还没问完
其中的如果xx是沿x方向的shiedling，那么xy,xz的物理意义又是啥？
在用multiwfn寻找非平面的NICS（1）zz时，需要用三个点定义一个平面来近似的描述需要计算的环。那么这三个点的 ...

磁屏蔽张量乘以外磁场矢量得到的矢量的负矢量就是感生磁场矢量，能够一定程度抵消外磁场。在乘的时候，显然非对角元也会影响结果（比如xy不为零，那么入射磁场在y上的分量将会对感生磁场的x分量产生贡献）
xy、xz这些非对角元也可以理解为是由于坐标间的耦合而存在的。通过特定方式选取坐标轴（也就是让三个轴和磁屏蔽张量的三个本征矢量方向一致），可以让这些非对角元恰为0。

对于非平面情况，怎么选那三个点有人为性，取决于实际情况。反正那三个点定义的平面应该尽可能表现出这个非平面体系的平面的大概样子。对于六元环，往往取1,3,5或者2,4,6是个合适的选择，但也不一定总如此。
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4楼2013-06-09 13:40:43
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一首琴歌

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sobereva at 2013-06-09 00:40:43
磁屏蔽张量乘以外磁场矢量得到的矢量的负矢量就是感生磁场矢量，能够一定程度抵消外磁场。在乘的时候，显然非对角元也会影响结果（比如xy不为零，那么入射磁场在y上的分量将会对感生磁场的x分量产生贡献）
xy、xz ...

那Xy矢量是在xy平面上而且和x轴呈45度吗？感觉帮助解读NMR的output file的基础材料很难找到啊，里面的很多信息都只能瞎猜?您有没有啥推荐的比较基础的材料呢

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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5楼2013-06-09 14:58:34
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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5楼: Originally posted by 一首琴歌 at 2013-06-09 14:58:34
那Xy矢量是在xy平面上而且和x轴呈45度吗？感觉帮助解读NMR的output file的基础材料很难找到啊，里面的很多信息都只能瞎猜?您有没有啥推荐的比较基础的材料呢
...

不是45度角这种意思。以前写过一些帖子，涉及到一些与NMR输出信息相关的内容你可以看看

将核独立化学位移(NICS)分解为sigma和pi轨道的贡献(http://hi.baidu.com/sobereva/item/9d7a96ab8f6adea828ce9dc6）
衡量芳香性的方法以及在Multiwfn中的计算
(http://hi.baidu.com/sobereva/item/0a4fb6fb77c4a648922af224)
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6楼2013-06-09 19:37:44
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一首琴歌

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sobereva at 2013-06-09 06:37:44
不是45度角这种意思。以前写过一些帖子，涉及到一些与NMR输出信息相关的内容你可以看看

将核独立化学位移(NICS)分解为sigma和pi轨道的贡献(http://hi.baidu.com/sobereva/item/9d7a96ab8f6adea828ce9dc6）
衡量 ...

很有帮助，感激不尽！
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7楼2013-06-10 03:05:08
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