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浅笑包包

新虫 (小有名气)

[求助] ITS测序

真菌ITS测序后发来的序列直接在Blast上进行分析吗？是直接把序列复制到Enter Query Sequence对话框吗？参数有需要设置的吗？需要裁剪吗？
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1楼 2013-06-02 15:17:48
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小虫s

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以先用contigexpress进行裁切和拼接，然后生成含有大于号的fast格式的文件，再进行你希望的下一步分析，不知你的分析目的是什么
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3楼2013-06-03 21:15:42
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710002191

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
浅笑包包(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-06-02 16:14:34
不清楚blast可以不，我们用的是biology edit，好像要先把序列粘到一个txt文档里，前面还要打上大于号，软件才可以识别的，具体参数的设置不是很清楚，但是一般都会把两头测得不好的裁剪去一些的。
新手一枚，师兄给演示过一次，希望对你有帮助
赞一下 回复此楼
may
2楼2013-06-02 16:02:02
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