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linkfuture

[交流] 核酸提取求助:帮忙分析下失败原因在哪?

我的提取程序是200ul总消化体积,1%SDS,200ug/ml,消化过夜.....
之后是标准酚氯仿抽提....
1%琼脂糖凝胶检测
只有最前沿有很弱的拖带出现(疑似RNA)

酚抽提后加入氯仿异戊醇(24:1)后离心后 上清很浑浊 出现大量絮状沉淀(这些是什么 蛋白质么?) ,
加入氯仿异戊醇(24:1)后 好象无法混匀 始终是分层状态,这样正常么,不是要摇成乳状,再离心么

我重新提了一次还是这个样子

[ Last edited by linkfuture on 2007-10-12 at 11:58 ]
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yangguoxing888

金虫 (小有名气)

瑜瑾


johnsooh(金币+1,VIP+0):thx
应该和上下颠倒的时间没关系。没准是你基因组提取后溶解,如果缓冲液多得话DNA浓度会低,这样也不一定能跑出来,至于前端的东西,没准是RNA。冷冻离心后为什么会出现混浊我也不知道,不过应该不是SDS预冷的原因。
瑜瑾
4楼2007-10-10 12:31:18
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guohuayin

木虫 (著名写手)

博士,副教授

★ ★
telomerase(金币+2,VIP+0):thanks!欢迎来多多交流!!!
抽提核酸中我的做法是
首先加入等体积的苯酚:氯仿:异戊醇(体积比25:24:1),轻轻上下颠倒几次,混匀2分钟左右,12000rpm,离心10分钟;
然后吸取上清液,加入等体积的氯仿:异戊醇(体积比24:1)和上面的步骤一样,抽提一次,取上清
这两步试验可以反复三次,主要是去除蛋白质和糖类等杂质。
最后加入1/10体积的3M的醋酸钠(.PH5.3),2倍体积的无水乙醇沉淀DNA。
-20度放置30分钟,室温15000rpm,离心10分钟,沉淀用70%的乙醇洗涤去除盐分,稍微干燥后,加入适量的缓冲液溶解。-20度冰箱中保存。

[ Last edited by guohuayin on 2007-10-9 at 16:33 ]
内生菌资源和核酸分子的利用
2楼2007-10-09 16:31:15
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linkfuture

谢谢楼上的 回复,,我的提取程序和你的差不多,

是不是我混匀时间太长 太剧烈 导致DNA断裂呢(我每次都要上下颠倒混匀10min)

氯仿异戊醇冷冻离心后为什么上清很浑浊呢 是SDS的遇冷的原因么 还是Pr
3楼2007-10-10 12:19:10
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tsguest

银虫 (初入文坛)


johnsooh(金币+1,VIP+0):thx
你上下颠倒混匀的时间太长了,这样容易把DNA弄断,而且如果你要是需要大片段的DNA,这样做更是不行。你如果把DNA一提出来,马上就跑,有可能就什么也跑不出来,你可以用TE溶了DNA后,在4度放置一晚,第二天再跑电泳就有可能有你提的DNA,祝你成功!
5楼2007-10-10 12:31:23
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