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分析了蛋白质信号肽，但是不太会看记过，怎么看有没有信号肽？三条线分别代表什么？
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英语不太好，实验室也没人做这一块，哎，各位大侠帮帮忙吧  信号肽预测.png |
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 蛋白表达纯化鉴定精华 | 植物病原细菌学 |
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mitocam
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【答案】应助回帖
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C-score (raw cleavage site score) The output from the CS networks, which are trained to distinguish signal peptide cleavage sites from everything else. Note the position numbering of the cleavage site: the C-score is trained to be high at the position immediately after the cleavage site (the first residue in the mature protein). S-score (signal peptide score) The output from the SP networks, which are trained to distinguish positions within signal peptides from positions in the mature part of the proteins and from proteins without signal peptides. Y-score (combined cleavage site score) A combination (geometric average) of the C-score and the slope of the S-score, resulting in a better cleavage site prediction than the raw C-score alone. This is due to the fact that multiple high-peaking C-scores can be found in one sequence, where only one is the true cleavage site. The Y-score distinguishes between C-score peaks by choosing the one where the slope of the S-score is steep. |
4楼2013-05-24 11:09:04
