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wl507586

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1楼2013-05-20 23:48:02

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yyuan8658

金虫 (正式写手)

应助: 43 (小学生)
金币: 598.8
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红花: 5
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虫号: 780863
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专业: 生物大分子结构与功能

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+5, 赞 2013-05-21 08:01:35
wl507586: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2013-05-21 09:11:13

1.计算pka，结果的可靠性要靠计算程序了。如果pka<7，说明是去质子化的，反之则是质子化的。不过这条对HIS不太管用，因为去质子化的HIS有HIE和HID
2.可视化检查。用VMD、PyMol等打开蛋白质的三维构象，看HIS侧链的ND1和NE2哪个可能和其它残基形成氢键，能形成氢键的，且H在HIS上更为合适的，就认定该N原子是质子化的。
据此来判断HID/HIE/HIP这三种状态。

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2楼2013-05-21 06:59:16

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