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fzfangtao

木虫 (正式写手)

[求助] Blast没结果，但想明白拟南芥该基因在其它物种的可能序列

如题。具体而言情况如下：目前已知拟南芥中某基因的具体序列与功能(GenBank可查)，但是我想明白该基因在其它植物物种中的具体可能序列，应该使用何种软件（在NCBI中Blast该物种没有结果）？若是进行基因克隆进行序列确定的话，大致步骤如何？
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1楼 2013-05-15 16:21:09
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
fzfangtao: 金币+1, ★★★很有帮助, 恩，我好像找到了，根据你所说的第三条，现在正在继续往下分析呵 2013-05-19 16:22:39
还是用NCBI的BLAST:
1, 在organism的选项里填arabidopsis (thaliana), "thaliana"填不填看你的实际情况. 然后勾上"exclude"
2 同样的地方填plant, 然后在下拉菜单中根据你的需要选一个最恰当的
3 如果没有比对结果, 再把比对参数改成"Somewhat similar sequences"
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2楼2013-05-15 16:31:22
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