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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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fzfangtao

木虫 (正式写手)

[求助] Blast没结果,但想明白拟南芥该基因在其它物种的可能序列

如题。具体而言情况如下:目前已知拟南芥中某基因的具体序列与功能(GenBank可查),但是我想明白该基因在其它植物物种中的具体可能序列,应该使用何种软件(在NCBI中Blast该物种没有结果)?若是进行基因克隆进行序列确定的话,大致步骤如何?
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
fzfangtao: 金币+1, ★★★很有帮助, 恩,我好像找到了,根据你所说的第三条,现在正在继续往下分析呵 2013-05-19 16:22:39
还是用NCBI的BLAST:
1, 在organism的选项里填arabidopsis (thaliana), "thaliana"填不填看你的实际情况. 然后勾上"exclude"
2 同样的地方填plant, 然后在下拉菜单中根据你的需要选一个最恰当的
3 如果没有比对结果, 再把比对参数改成"Somewhat similar sequences"
2楼2013-05-15 16:31:22
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