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luoyiwei

金虫 (小有名气)

[求助] MS模拟扩散系数时怎么全选气体分子分析均方位移

我用materials studio模拟乙醇分子在聚合物中的扩散,在discovery analysis之前需要将气体分子定义为一组时才能分析均方位移。但是由于我放的乙醇分子很多(55个),请教大神们我怎么才能将乙醇分子全部选中,定义为一组?文献里也有乙醇分子的扩散例子,但是分子数都很少,我想那样一个一个全选也可以,但是我这个实在太多了。
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
edit - atom selection - 根据乙醇的性质来选择
2楼2013-05-16 21:28:37
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luoyiwei

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cg陈 at 2013-05-16 21:28:37
edit - atom selection - 根据乙醇的性质来选择

你说的方法只能选择原子的吧,以前选择O2分子的时候是先将O原子按力场类型标记(label),然后atom selection里根据力场选择所有的O原子。但是我现在的乙醇分子本身就不是只有C或H或O原子,而是三种原子的集合,用你说的方法也只能选中其中的一种原子啊,怎么同时选中另外两种原子呢?
3楼2013-05-17 15:04:18
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

选中原子后 选择fragment  这样子乙醇可以选中了吧
4楼2013-05-18 12:56:39
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luoyiwei

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cg陈 at 2013-05-18 12:56:39
选中原子后 选择fragment  这样子乙醇可以选中了吧

你说的方法是可以选中一个乙醇分子,但是我想把其他的乙醇分子一起选中,好像就实现不了。
5楼2013-05-19 10:50:29
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
luoyiwei: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-05-20 16:50:16
哎 你可以用forcefield选择所有乙醇分子中的原子 例如O呀 然后fragment就可以选中所以乙醇分子
6楼2013-05-20 10:06:44
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luoyiwei

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by cg陈 at 2013-05-20 10:06:44
哎 你可以用forcefield选择所有乙醇分子中的原子 例如O呀 然后fragment就可以选中所以乙醇分子

谢谢大神,看似简单的问题我都请教了“无数人”,在你这里终于找到了答案。
7楼2013-05-20 16:51:01
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自由的自我

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by luoyiwei at 2013-05-20 16:51:01
谢谢大神,看似简单的问题我都请教了“无数人”,在你这里终于找到了答案。...

请问对于乙醇和水的体系,想选择所有的乙醇分子,是先用forcefield type ,选中乙醇中的一个氧原子,然后 fragment是在哪里?菜鸟不懂啊 能不能说具体点 谢谢拉
8楼2014-07-24 13:38:12
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ljl7701496

新虫 (初入文坛)

为什么我向里面加co,总是错误呢?
9楼2016-01-15 16:04:49
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