应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS模拟扩散系数时怎么全选气体分子分析均方位移
91/1返回列表
查看: 2682  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

luoyiwei

金虫 (小有名气)

[求助] MS模拟扩散系数时怎么全选气体分子分析均方位移

我用materials studio模拟乙醇分子在聚合物中的扩散，在discovery analysis之前需要将气体分子定义为一组时才能分析均方位移。但是由于我放的乙醇分子很多（55个），请教大神们我怎么才能将乙醇分子全部选中，定义为一组？文献里也有乙醇分子的扩散例子，但是分子数都很少，我想那样一个一个全选也可以，但是我这个实在太多了。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-05-15 15:15:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
edit - atom selection - 根据乙醇的性质来选择
赞一下 回复此楼
2楼2013-05-16 21:28:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luoyiwei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cg陈 at 2013-05-16 21:28:37
edit - atom selection - 根据乙醇的性质来选择

你说的方法只能选择原子的吧，以前选择O2分子的时候是先将O原子按力场类型标记（label），然后atom selection里根据力场选择所有的O原子。但是我现在的乙醇分子本身就不是只有C或H或O原子，而是三种原子的集合，用你说的方法也只能选中其中的一种原子啊，怎么同时选中另外两种原子呢？
赞一下 回复此楼
3楼2013-05-17 15:04:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

选中原子后 选择fragment  这样子乙醇可以选中了吧
赞一下 回复此楼
4楼2013-05-18 12:56:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luoyiwei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cg陈 at 2013-05-18 12:56:39
选中原子后 选择fragment  这样子乙醇可以选中了吧

你说的方法是可以选中一个乙醇分子，但是我想把其他的乙醇分子一起选中，好像就实现不了。
赞一下 回复此楼
5楼2013-05-19 10:50:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
luoyiwei: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-05-20 16:50:16
哎 你可以用forcefield选择所有乙醇分子中的原子 例如O呀 然后fragment就可以选中所以乙醇分子
赞一下 回复此楼
6楼2013-05-20 10:06:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luoyiwei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by cg陈 at 2013-05-20 10:06:44
哎 你可以用forcefield选择所有乙醇分子中的原子 例如O呀 然后fragment就可以选中所以乙醇分子

谢谢大神，看似简单的问题我都请教了“无数人”，在你这里终于找到了答案。
赞一下 回复此楼
7楼2013-05-20 16:51:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

自由的自我

铁杆木虫 (著名写手)

无
引用回帖:
7楼: Originally posted by luoyiwei at 2013-05-20 16:51:01
谢谢大神，看似简单的问题我都请教了“无数人”，在你这里终于找到了答案。...

请问对于乙醇和水的体系，想选择所有的乙醇分子，是先用forcefield type ，选中乙醇中的一个氧原子，然后 fragment是在哪里？菜鸟不懂啊 能不能说具体点 谢谢拉
赞一下 回复此楼
无
8楼2014-07-24 13:38:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ljl7701496

新虫 (初入文坛)
为什么我向里面加co，总是错误呢？
赞一下 回复此楼
9楼2016-01-15 16:04:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 luoyiwei 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +8 一鸭鸭哟 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:35 by 沐霖12138
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-15 6/300 2026-03-16 08:00 by wang_dand
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 294求调剂 +3 Zys010410@ 2026-03-13 4/200 2026-03-15 10:59 by zhq0425
[基金申请] 面上和青基一样限30页不合理 +5 wowsunflower 2026-03-10 7/350 2026-03-14 17:21 by kingkocxr
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 调剂 +3 13853210211 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:47 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:30 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +3 番茄头--- 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:07 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 +5 隔壁陈先生 2026-03-12 5/250 2026-03-13 22:03 by 星空星月
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 293求调剂 +3 世界首富 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:27 by JourneyLucky
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 314求调剂 +7 无懈可击的巨人 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:43 by houyaoxu
[考研] 296求调剂 +3 大口吃饭 身体健 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:31 by 学员8dgXkO
[考博] 2026年博士申请 +3 QwQwQW10 2026-03-11 3/150 2026-03-12 17:58 by gxch43
[考研] 研究生招生 +3 徐海涛11 2026-03-10 7/350 2026-03-12 14:26 by 徐海涛11
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭