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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 帮忙提示一个软件
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glossitian

木虫 (著名写手)

[求助] 帮忙提示一个软件

已知蛋白质受体结构，使用什么软件设计能和该蛋白质受体结合的小分子？有没有免费软件资源？
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1楼 2013-05-13 14:53:22
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1：虚拟筛选，从ZINC等数据库中筛选出计算机认为有活性的化合物(打分比较靠前），然后用实验证实，接着你自己可以改造这些分子了，涉及的虚拟筛选软件DOCK，DS，PYRX等
2：自己设计，按照文献中报导的已经有明确机理或者作用模式的化合物，进行改造，进行构效关系分析，设计新的结构等等。
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3楼2013-05-13 15:24:10
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yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
要是有软件能根据蛋白质结构直接设计出与之结合的小分子，就不需要虚拟筛选了
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2楼2013-05-13 15:18:36
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glossitian

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by longytu at 2013-05-13 15:24:10
1：虚拟筛选，从ZINC等数据库中筛选出计算机认为有活性的化合物(打分比较靠前），然后用实验证实，接着你自己可以改造这些分子了，涉及的虚拟筛选软件DOCK，DS，PYRX等
2：自己设计，按照文献中报导的已经有明确机 ...

这几个软件，哪个好用哈？还有是不是要收费的哈，我就不考虑了。
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4楼2013-05-13 16:12:30
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