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emanlee木虫 (小有名气)
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[求助]
如何理解RNA-Seq基因表达数据（Count，或 FPKM）服从泊松分布
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请问如何理解微阵列基因表达数据服从正态分布？是指一个Array中的表达数据，还是全部数据合在一起？ 请问如何理解RNA-Seq基因表达数据（Count，或 FPKM）服从泊松分布，负二项分布？ |
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emanlee
木虫 (小有名气)
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3楼2013-05-13 15:20:02
【答案】应助回帖
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wizardfan: 金币+5, 鼓励新虫发帖，分析得很好 2013-05-14 08:39:39
emanlee: 金币+10, ★有帮助 2013-05-20 20:48:22
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emanlee: 金币+10, ★有帮助 2013-05-20 20:48:22
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1 应该是指一个array中的数据就是正态分布，因为常用的t检验法筛选差异基因都是一个array一个array来进行的，也就是认为每个array都服从正态分布了 2 在RNA-Seq中，每个基因会对应多少个读段是一个计数型的随机变量，计数型随机变量分布类型通常就是离散分布里面那几个，泊松分布是最常见的一个了，加上有通常假定每个read在基因组序列上是均匀分布的，故一个基因对应的read数服从速率恒定的泊松分布（当然也可以推广至速率变化的泊松分布，那就得改变前提假设了） 以上是个人理解，希望有帮助！多多交流！   |
2楼2013-05-13 09:42:45
emanlee
木虫 (小有名气)
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4楼2013-05-13 15:35:56
wizardfan
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5楼2013-05-14 08:39:13
40