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sunzhengwang

铁虫 (小有名气)

[求助] RNA A260/280>2 是神马情况? 已有1人参与

好质量的RNA 260/280值应该在1.9-2.0,
但是最近提取的RNA  A260/280>2,A260/230>2,
请问各位虫友,这是个神马情况?
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一手生存,一手梦想
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chinatiger

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sunzhengwang(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-05-10 13:00:10
gyesang: 回帖置顶 2013-05-10 13:00:24
sunzhengwang: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-05-10 15:16:13
1949stone: MolEPI+1, good 2013-05-11 20:30:21
如果在2.1之上,说明可能存在DNA污染。此外,单纯看比值意义不大,下列文字仅供参考:
1. A260nm 是核酸最高吸收峰的吸收波长,最佳测量值的范围为 0.1 至 1.0。如果不在此范围,稀释或浓缩样品,使 之在此范围内;如果吸光度小于 0.05,检查是否存在操作因素(如移液不准确,样品内有悬浮物等)影响。 DNA 样品的 A260 吸光度值是否>0.1。(请注意,这个值跟仪器无关,核酸的吸光度必需大于 0.1,其值才 有效和可靠,因为样品中的杂质和颗粒这些不纯物的干扰通常会对光有一定吸收,其值<0.1);

2. A280nm, A270nm 是蛋白最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯 DNA 的 A260/A280 比值为 1.8,纯 RNA 为 2.0。如果比值低,表示受到蛋白(芳香族)或酚类物质的污染,需要纯化样品。比值=1.5 相当于 50% 蛋白质/DNA 溶液.酚的最大吸收峰在 270nm。

3. A230nm 是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯 DNA 和 RNA 的 A260/A230 比值为 2.5。若比值小于 2.0 标明样品被碳水化合物(糖类)、盐类或有机溶剂污染,需要纯化样品。A230 产生 负值主要是由于在很低 DNA 浓度的溶液中的一些其他成分的干扰所导致的。在下一个测定中,需要降低样 品的稀释度,A230 的负值会被校正。

4. A320nm 或 A340nm 为检测溶液样品的浊度和其他干扰因子。该值应该接近0.0。如果不是,标明溶液中有悬浮物,需要纯化样品。纯样品的A320一般是 0。

5. A260/A280和A260/A230 是核酸纯度的指示值。纯度好的DNA或RNA,在pH7-8.5 下A260 / A280的比值应该在2.0 或2.5。纯净的样品比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8 或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。A230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物、盐(胍盐)等,较纯净的核酸A260/A230的比值大于2.0 。

当 0.5%BSA蛋白质污染时,蛋白污染会导致260和280的数值都下降,其净结果是260/280比值下降,但260/280的比值变化并不显著,正如分子克隆3所说。但蛋白残留会导致230的数值显著上升,显著影响260/230的比值。也就是说,如果RNA样品的260/280=1.7,260 /230=0.5,那么就应该考虑污染原因不是胍盐残留,而是蛋白残留.

其他:
用分光光度计测量RNA时,用水而不是用TE 缓冲液稀释RNA样品会造成A260/A280比值下降。原因是低离子强度和低pH溶液会增加280 nm处的光吸收值。
加氯仿离心后取上清的时候千万不要贪多 ,那样就很容易被蛋白污染,所以现在一般取400ul左右。
当260/230<1时,只有两种情况。一是胍盐污染,二是蛋白污染。
15楼2013-05-10 11:39:21
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纯木木鱼

新虫 (初入文坛)

本帖内容被屏蔽

2楼2013-05-09 09:31:26
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tingting0531

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
sunzhengwang(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊。快乐每一天 2013-05-10 08:27:18
我也遇到过,师哥说针对不同的试剂盒,有可能比值大于2.0
努力努力
3楼2013-05-09 21:12:47
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
sunzhengwang(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物版块期待你的更多精彩。 2013-05-10 08:33:32
我这里量出来一直是2.1的样子, 没问题的.
4楼2013-05-09 22:03:31
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