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hraikeyan

金虫 (小有名气)

[求助] 蛋白破碎后,上清的活性很低

各位好心人,我最近在做蛋白表达。全细胞的酶活很高,用超声破碎后,破碎后上清活性很低,但沉淀的活性很高。蛋白电泳结果也是一样的,上清的条带很暗,沉淀很粗。我想应该是破碎不完全吧。我的破碎条件是这样的:破碎1s,暂停2s。总共这样循环破1h,功率45%。
各位做蛋白表达的同志们,能否给我些建议,我想我这应该不是形成包涵体吧,但是都破碎了1h了,沉淀中还是有好多目的蛋白。
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nothing isimpossible
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roomofxw

木虫 (正式写手)

引用回帖:
14楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-05-08 13:33:26
粉碎细胞时的沉淀当然可能是有活性的,但是形成固体颗粒状的包涵体肯定没有生物活性。我说的是固体颗粒的蛋白质异常折叠盒凝聚物是没有生物活性。至于一个概念的提出是否会被广泛接受与其被提出的时间没有直接关联, ...

定义的范围不一样罢了
你指的是严格意义的包涵体
我指的只是破碎细胞的沉淀蛋白
当然这种现象不只一两篇文献
例如,淀粉样蛋白正确情况就会产生聚集开始沉淀,而标记抗体的藻胆蛋白形成沉淀也依然发荧光,趋化因子系列蛋白我也正在探索。
它们可能不涉及二硫键错配,结构大量折叠错误,仅仅是蛋白结构的特性导致松散的聚集在一起,通过缓冲液的改变,或者就是测活缓冲液环境的不同,就解离复溶了。
16楼2013-05-09 09:10:19
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖


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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,鼓励应助,分子生物版块期待你的更多精彩。同样期待你更详细的应助指导。 2013-05-08 09:11:58
"蛋白电泳结果也是一样的,上清的条带很暗,沉淀很粗。"应该是形成了包涵体。但沉淀的活性很高,说明沉淀里有很多目的蛋白质不是包涵体,因为包涵体是变性的聚集体,一般为固体形态,没有生物活性。
2楼2013-05-07 21:55:22
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

我想可能是酶与某些其他成分形成了共聚物,但是没有聚集成为固体状态,或者说类似于固定化酶的形态,所以目的酶还是有生物活性。
3楼2013-05-07 21:57:30
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖


myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,鼓励应助,分子生物版块期待你的更多精彩。同样期待你更详细的应助指导。 2013-05-08 09:12:08
既然不清楚“固定化”酶本身与非酶的介质之间的链接到底是什么?那么可以先用破坏非共价键的把“固定化”酶从介质上解脱下来。比如用加入一些表面活性剂破坏“固定化”酶本身与非酶的介质之间的疏水相互作用,然后离心试试看。比如可以用低浓度的去污剂(浓度不大于2%的Triton X-100或浓度不大于0.5%SDS)洗涤样品(上样洗脱时);增加洗脱液的盐浓度(氯化钠溶液低于2mol/L);上样液里加入30%-50%的甘油,已减弱疏水相互作用,然后过层析住加以分离;或者用硫酸铵沉淀蛋白质-----分离蛋白质与生物大分子,而后除去硫酸铵再用用层析;如果酶石墨蛋白质则可用丙酮分级分离;另外疏水层析和离子交换树脂也可以用上;实在分离不开就用SDS-PAGE电泳分离,然后回收凝胶中 的蛋白质再进行复性。

  
4楼2013-05-07 22:09:57
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