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linyusuc银虫 (小有名气)
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[求助]
gromacs关于能量计算的疑问
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请教各位高手: 对于gromacs中定义的能量vdw1-4和vdw（SR）分别指的是什么 为什么对于单一的一个分子在真空中计算的vdw1-4和100个分子在周期性边界条件下计算得到的vdw1-4，二者并不是100倍的关系呢，分子动力学模拟中所施加的这种周期性边界条件将会对模拟体系的能量和性质有着怎样的影响呢？另外，对于分子动力学模拟的可靠性是如何检验的，请各位多指点！ |
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