版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

返回列表

zhaobomc

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 525.1
帖子: 90
在线: 63.1小时
虫号: 806216
注册: 2009-07-09
专业: 实验动物学

[求助] 求助：CIF的问题

我在写好文章后，使用PUBCIF时出现两个问题，请问各位怎么回事：
Results of VCIF syntax checking...
ERROR: Number of loop elements not multiple of packetsize at line 1125
--------------------------------------------------------------------------
VCIFF output
Errors:
Loop imbalance - unable to check this loop further (line 919)

在919行是C4 H4A F13 0.93 2.52 3.430(4) 166.3 1_545
而1125行是：data_II

未命名.JPG

未命名1.JPG

回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

新手求助pubcif添加图片问题以及checkcif时的C类和G类问题已经有8人回复
【求助】CIF改错已经有11人回复
【求助】用checkcif文件中z值不对怎么办？已经有3人回复
【求助】check CIF时遇到的一个错误高手请进来指导一下已经有14人回复
【求助】请朋友们帮我看看检测完的cif文件！已经有7人回复
【求助】CIF中的atom_site_occupancy值小于1的意义是什么？已经有3人回复
【求助】求cif文件在线检测的网址已经有3人回复
【求助】重金求助晶体解析问题已经有9人回复
【求助】请教两个A问题已经有5人回复
【求助】cif文件的填写问题已经有11人回复
【求助】cif check A,B类错误已经有5人回复
【求助】关于申请ccdc号和检查cif的问题已经有3人回复
【求助】求教对CIF文件中2个A类错误的解释已经有8人回复

1楼 2013-05-06 20:39:14

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

luxtal

至尊木虫 (职业作家)

应助: 691 (博士)
金币: 13882.5
红花: 50
帖子: 3005
在线: 701.3小时
虫号: 2014485
注册: 2012-09-19
专业: 结构化学

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

你附的图信息量不大，很多时候问题不是处在程序提示的那一行上。

赞一下

回复此楼

What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg

2楼2013-05-06 22:53:01

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

wangkj

3楼2013-05-06 23:39:47

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zhaobomc

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 525.1
帖子: 90
在线: 63.1小时
虫号: 806216
注册: 2009-07-09
专业: 实验动物学

引用回帖:

2楼: Originally posted by luxtal at 2013-05-06 22:53:01
你附的图信息量不大，很多时候问题不是处在程序提示的那一行上。

您好，我看了下应该是上面那个晶体的影视文件有以点点问题，不知能否帮忙看看啊？

TITL A in C2/c
CELL 0.71073  31.9484 6.7056  24.5612  90.000 109.449  90.000
ZERR 8.00 0.0114 0.0024 0.0085 0.000 0.005 0.000
LATT 7
SYMM -X, Y, 0.5-Z
SFAC C  H  N  O  F  P
UNIT 152 168 40 0 96 16
OMIT -3 52
OMIT 0 0 2
OMIT -2 0 6
ISOR 0.01 F9
L.S. 30
SIZE 0.34 0.32 0.26
ACTA
BOND $H
HTAB
CONF
FMAP 2
PLAN 20
TEMP 23.000
eqiv $1 (x,-1+y,z)_
eqiv $2 (-x,y,0.5-z)
eqiv $3 (0.5-x,1.5-y,1-z)
eqiv $4 (x,2-y,0.5+z)
eqiv $5 (x,1-y,0.5+z)
htab C4 F13_$1
htab C6 F12_$2
htab C15 F3_$3
htab C15 F3_$4
htab C17 F5_$1
htab C17 F5_$5
WGHT    0.0962    4.9212
FVAR    0.04391
P1 6 0.243842 0.894037 0.352348 11.00000 0.05460 0.06101 =
      0.06907 -0.00604 0.01583 0.00352
P2 6 0.000000 0.500000 0.000000 10.50000 0.05208 0.05414 =
      0.07291 -0.00184 0.01817 -0.00439
P3 6 0.000000 0.974620 0.250000 10.50000 0.07091 0.06717 =
      0.06239 0.00000 0.00737 0.00000
C1 1 0.175383 0.499534 0.433446 11.00000 0.07189 0.05899 =
      0.07647 -0.00762 0.04038 -0.00126
AFIX  43
H1A 2 0.203318 0.532186 0.458972 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C2 1 0.169813 0.337223 0.398351 11.00000 0.10540 0.06857 =
      0.10326 -0.01114 0.06834 0.00011
AFIX  43
H2A 2 0.194105 0.258070 0.399984 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C3 1 0.127278 0.288445 0.359440 11.00000 0.12415 0.08056 =
      0.07064 -0.02419 0.05424 -0.02662
AFIX  43
H3A 2 0.124218 0.176195 0.336196 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C4 1 0.091636 0.397228 0.354974 11.00000 0.10444 0.08216 =
      0.05277 -0.01013 0.02952 -0.02775
AFIX  43
H4A 2 0.064034 0.363099 0.328851 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C5 1 0.096607 0.564828 0.390589 11.00000 0.05359 0.04954 =
      0.03096 0.00111 0.00926 -0.00793
C6 1 0.067207 0.693980 0.394708 11.00000 0.06641 0.07523 =
      0.05151 0.01338 0.00042 -0.01243
AFIX  43
H6A 2 0.037163 0.692323 0.373003 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C7 1 0.131218 0.784324 0.458445 11.00000 0.05600 0.04355 =
      0.04921 0.00431 0.01943 0.00141
C8 1 0.066042 0.993486 0.456103 11.00000 0.05737 0.05617 =
      0.08573 0.00958 0.02015 0.01429
AFIX  23
H8A 2 0.049492 0.940863 0.479614 11.00000 -1.20000
H8B 2 0.045534 1.064173 0.423672 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C9 1 0.101297 1.133352 0.491208 11.00000 0.06790 0.04690 =
      0.08724 0.00804 0.03019 0.01060
AFIX  23
H9A 2 0.113552 1.206743 0.465981 11.00000 -1.20000
H9B 2 0.088422 1.228557 0.510825 11.00000 -1.20000
AFIX 0
N3 3 0.136716 1.021505 0.533838 11.00000 0.05868 0.04474 =
      0.06642 -0.00491 0.02641 -0.00185
C11 1 0.166327 1.152802 0.577834 11.00000 0.07496 0.05851 =
      0.08014 -0.01618 0.03480 -0.01544
AFIX  23
H11A  2 0.172047 1.273091 0.559528 11.00000 -1.20000
H11B  2 0.194453 1.085873 0.595990 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C12 1 0.146122 1.207929 0.623286 11.00000 0.09864 0.05839 =
      0.09338 -0.02212 0.04613 -0.01577
AFIX  23
H12A  2 0.166544 1.292927 0.651974 11.00000 -1.20000
H12B  2 0.118975 1.282502 0.605486 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C13 1 0.096649 0.936705 0.638002 11.00000 0.05538 0.09173 =
      0.07347 -0.00260 0.01954 -0.00382
AFIX  43
H13A  2 0.070227 0.979415 0.610827 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C14 1 0.102080 0.769057 0.670871 11.00000 0.04898 0.07948 =
      0.04928 -0.00877 0.01213 -0.00654
C15 1 0.166403 0.925085 0.691399 11.00000 0.05892 0.08637 =
      0.06622 -0.02695 0.02411 -0.01778
AFIX  43
H15A  2 0.196282 0.957791 0.707651 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C16 1 0.164196 0.607608 0.742803 11.00000 0.06916 0.11088 =
      0.06089 -0.00175 0.02117 0.02263
AFIX  43
H16A  2 0.194078 0.606274 0.765245 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C17 1 0.137254 0.459855 0.746912 11.00000 0.10194 0.09651 =
      0.06753 0.00925 0.04240 0.02546
AFIX  43
H17A  2 0.148610 0.353267 0.771652 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C18 1 0.091348 0.465012 0.713640 11.00000 0.10693 0.09436 =
      0.07826 -0.00316 0.05080 -0.01276
AFIX  43
H18A  2 0.072808 0.363430 0.717754 11.00000 -1.20000
AFIX 0
C19 1 0.074444 0.613344 0.676595 11.00000 0.06483 0.11006 =
      0.07104 0.00173 0.01939 -0.01760
AFIX  43
H19A  2 0.044452 0.613577 0.654637 11.00000 -1.20000
AFIX 0
F1 5 0.246412 1.121829 0.338949 11.00000 0.10236 0.06597 =
      0.17290 0.01890 0.01970 0.00954
F2 5 0.296593 0.876010 0.372656 11.00000 0.05658 0.07856 =
      0.09374 -0.00113 0.01679 0.00358
F3 5 0.240912 0.838511 0.288336 11.00000 0.09690 0.15791 =
      0.07245 -0.01776 0.01590 0.03474
F4 5 0.241106 0.664256 0.364506 11.00000 0.09416 0.07079 =
      0.18149 0.01161 0.04609 -0.00792
F5 5 0.191379 0.914818 0.331791 11.00000 0.05440 0.11825 =
      0.13910 -0.03796 0.02131 0.00854
F6 5 0.247485 0.947249 0.416063 11.00000 0.11401 0.19191 =
      0.07894 -0.02617 0.03214 0.03705
F7 5 0.016001 0.683357 0.042629 11.00000 0.08233 0.09874 =
      0.12893 -0.04776 0.02689 -0.01703
F8 5 0.049777 0.431310 0.019152 11.00000 0.05791 0.09759 =
      0.16009 -0.02594 0.01502 0.00752
F9 5 -0.007404 0.374209 0.049507 11.00000 0.13007 0.16547 =
      0.10113 0.03552 0.01069 -0.07374
F10 5 0.052059 0.973428 0.280538 11.00000 0.06853 0.11361 =
      0.11941 -0.01134 0.00282 -0.00341
F11 5 0.000000 0.739373 0.250000 10.50000 0.10503 0.06279 =
      0.16211 0.00000 0.04803 0.00000
F12 5 0.006321 0.973441 0.188522 11.00000 0.13858 0.16017 =
      0.07898 -0.01592 0.03584 -0.05455
F13 5 0.000000 1.210701 0.250000 10.50000 0.13898 0.06802 =
      0.12655 0.00000 -0.00685 0.00000
N1 3 0.087089 0.828512 0.434946 11.00000 0.05394 0.05324 =
      0.05948 0.01120 0.01417 0.00649
N2 3 0.138060 0.617235 0.430410 11.00000 0.08939 0.06396 =
      0.06467 0.00680 0.03659 -0.00189
C10 1 0.162118 0.908497 0.504166 11.00000 0.05546 0.04931 =
      0.06422 -0.00010 0.02121 0.00390
AFIX  23
H10A  2 0.183741 0.824151 0.531588 11.00000 -1.20000
H10B  2 0.177898 0.999669 0.487220 11.00000 -1.20000
AFIX 0
N4 3 0.136244 1.030386 0.651645 11.00000 0.06821 0.06753 =
      0.06194 -0.01834 0.02632 -0.00490
N5 3 0.146819 0.763503 0.704404 11.00000 0.05605 0.08466 =
      0.04961 -0.01749 0.01677 0.00278

HKLF 4

REM  A in C2/c
REM R1 =  0.0589 for 3371 Fo > 4sig(Fo)  and  0.0814 for all 4881 data
REM 346 parameters refined using    6 restraints

END

WGHT    0.0962    4.9212
REM Highest difference peak  0.499,  deepest hole -0.402,  1-sigma level  0.053
Q1 1 0.1084  0.5409  0.3920  11.00000  0.05 0.50
Q2 1 0.0934  0.5257  0.3811  11.00000  0.05 0.44
Q3 1  -0.0003  0.2859  0.0106  11.00000  0.05 0.38
Q4 1 0.2519  0.9972  0.3015  11.00000  0.05 0.38
Q5 1 0.2426  0.7222  0.3237  11.00000  0.05 0.38
Q6 1 0.2517  1.1046  0.3863  11.00000  0.05 0.35
Q7 1 0.0362  0.5041 -0.0223  11.00000  0.05 0.34
Q8 1 0.0146  0.3105  0.0291  11.00000  0.05 0.32
Q9 1  -0.0086  0.4860  0.0517  11.00000  0.05 0.30
Q10 1  -0.0141  0.3861  0.0598  11.00000  0.05 0.29
Q11 1 0.2231  0.9007  0.3997  11.00000  0.05 0.29
Q12 1 0.2388  0.7681  0.3957  11.00000  0.05 0.29
Q13 1  -0.0284  1.0243  0.1848  11.00000  0.05 0.20
Q14 1 0.0079  0.8202  0.2123  11.00000  0.05 0.19
Q15 1 0.2218  1.0658  0.3292  11.00000  0.05 0.19
Q16 1 0.2177  0.8336  0.2794  11.00000  0.05 0.18
Q17 1 0.0777  0.9060  0.4423  11.00000  0.05 0.18
Q18 1 0.0000  0.6519  0.2500  10.50000  0.05 0.17
Q19 1 0.0061  1.1347  0.2097  11.00000  0.05 0.17
Q20 1 0.0505  1.0562  0.2474  11.00000  0.05 0.17

赞一下

回复此楼

4楼2013-05-07 09:24:47

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

luxtal

至尊木虫 (职业作家)

应助: 691 (博士)
金币: 13882.5
红花: 50
帖子: 3005
在线: 701.3小时
虫号: 2014485
注册: 2012-09-19
专业: 结构化学

【答案】应助回帖

★ ★ ★
zhaobomc: 金币+3, 谢谢 2013-05-07 11:25:49

你贴出来的不是cif文件，是res文件。

赞一下

回复此楼

What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg

5楼2013-05-07 10:23:07

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zhaobomc

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 525.1
帖子: 90
在线: 63.1小时
虫号: 806216
注册: 2009-07-09
专业: 实验动物学

引用回帖:

5楼: Originally posted by luxtal at 2013-05-07 10:23:07
你贴出来的不是cif文件，是res文件。

就是在RES文件里面有点问题

赞一下

回复此楼

6楼2013-05-07 10:36:44

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

546672286

金虫 (著名写手)

应助: 69 (初中生)
金币: 2592.3
散金: 548
红花: 5
帖子: 1062
在线: 248小时
虫号: 938539
注册: 2010-01-07
性别: GG
专业: 配位化学

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

引用回帖:

6楼: Originally posted by zhaobomc at 2013-05-07 10:36:44
就是在RES文件里面有点问题...

你把提示的错误贴出来啊

赞一下

回复此楼

7楼2013-05-07 10:59:33

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

546672286

金虫 (著名写手)

应助: 69 (初中生)
金币: 2592.3
散金: 548
红花: 5
帖子: 1062
在线: 248小时
虫号: 938539
注册: 2010-01-07
性别: GG
专业: 配位化学

【答案】应助回帖

晶体数据，我们一般用CheckCIF，自动提示你CIF，A,B错误是什么

赞一下

回复此楼

8楼2013-05-07 11:02:08

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zhaobomc

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 525.1
帖子: 90
在线: 63.1小时
虫号: 806216
注册: 2009-07-09
专业: 实验动物学

引用回帖:

7楼: Originally posted by 546672286 at 2013-05-07 10:59:33
你把提示的错误贴出来啊...

Results of VCIF syntax checking...
ERROR: Number of loop elements not multiple of packetsize at line 1125
--------------------------------------------------------------------------
VCIFF output
Errors:
Loop imbalance - unable to check this loop further (line 919)

赞一下

回复此楼

9楼2013-05-07 11:08:26

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zhaobomc

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 525.1
帖子: 90
在线: 63.1小时
虫号: 806216
注册: 2009-07-09
专业: 实验动物学

引用回帖:

8楼: Originally posted by 546672286 at 2013-05-07 11:02:08
晶体数据，我们一般用CheckCIF，自动提示你CIF，A,B错误是什么

Alert level B
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for N2 -- C1 .. 7.3 su
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for N2 -- C5 .. 25.0 su
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for N2 -- C7 .. 11.0 su
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for C4 -- C5 .. 7.3 su
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for C5 -- C6 .. 20.0 su
Alert level C
PLAT241_ALERT_2_C Check High Ueq as Compared to Neighbors for N2
PLAT241_ALERT_2_C Check High Ueq as Compared to Neighbors for C6
PLAT242_ALERT_2_C Check Low Ueq as Compared to Neighbors for C5
PLAT244_ALERT_4_C Low ’Solvent’ Ueq as Compared to Neighbors of P1
PLAT244_ALERT_4_C Low ’Solvent’ Ueq as Compared to Neighbors of P2
PLAT244_ALERT_4_C Low ’Solvent’ Ueq as Compared to Neighbors of P3
PLAT340_ALERT_3_C Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.0059 Ang
PLAT910_ALERT_3_C Missing # of FCF Reflections Below Th(Min) ..... 2
PLAT911_ALERT_3_C Missing # FCF Refl Between THmin & STh/L= 0.600 6
PLAT912_ALERT_4_C Missing # of FCF Reflections Above STh/L= 0.600 2
Alert level G
PLAT003_ALERT_2_G Number of Uiso or Uij Restrained Atom Sites .... 1
PLAT005_ALERT_5_G No _iucr_refine_instructions_details in CIF .... ?
PLAT860_ALERT_3_G Note: Number of Least-Squares Restraints ....... 6
0 ALERT level A = Most likely a serious problem - resolve or explain
5 ALERT level B = A potentially serious problem, consider carefully
10 ALERT level C = Check. Ensure it is not caused by an omission or oversight
3 ALERT level G = General information/check it is not something unexpected
0 ALERT

赞一下

回复此楼

10楼2013-05-07 11:09:29

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

相关版块跳转我要订阅楼主 zhaobomc 的主题更新

返回列表