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zealotxk

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于两段肽链之间的夹角的计算

在有些论文里看到有关于两段肽链夹角的描述或者讨论,比如:一段alpha螺旋和另一段肽链之间的角度随着MD的进行发生了某些变化。我的疑问是,这样的角度是怎么得到的?

我对这个问题的看法是,这种表述本身应该就不是一种非常严谨的表述,所以这种角度的描述是否也只是一种粗略描述,并不是很精确?那么在具体测量这个角度的时候,是不是也只需要进行粗略的估算即可?
比如取肽链两端C原子的连线作为这段肽链的近似的轴线,然后计算两个轴线夹角。或者采用精确的一点的方法,分别统计两段肽链中原子分布的几何中心,拟合出两根轴线。


希望我已把问题表述清楚了。
我是纯新手,请大家不吝赐教。
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