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O天琊O

银虫 (小有名气)

[求助] 有关G-四聚体/G-四分体的问题

请教各位大神,一个颈环结构的DNA,颈上有8个或9个碱基,环上有15个;环上的这15个碱基能够形成G-四聚体结构,现在我有几个个问题:
     1)在含有K离子的溶液中将该DNA热变性后缓慢降温,DNA是容易形成颈环结构还是G-四分体的构象?在这个分子中,颈的互补配对的碱基对,与环的G-四分体能不能同时存在?
    2)倘若环上的15个碱基形成G-四分体构象,那么能不能将颈上的8个或9个碱基打开?我看的有文献说G-四分体其实是依赖于G之间的氢键作用,那么是不是打不开颈上的碱基对呢?
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没有什么不可以
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O天琊O

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by porphybaby at 2013-04-27 00:26:13
第一个问题的话 其实 形成G-四链体的可能性会很大啊我觉得

因为K离子 跟 G-四链体的 亲和力是很大的

互补配对的话 好像如果你的体系中也存在 Mg离子之类的 就有助于它形成双链 共存我觉得你要看序列了

第 ...

有没有环是四分体,颈仍然可以维持呢

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
没有什么不可以
3楼2013-04-28 08:19:28
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porphybaby

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
O天琊O(myprayer代发): 金币+2, 赠人玫瑰手有余香,鼓励应助,分子生物版块期待你的更多精彩。同样期待你更详细的应助指导。 2013-04-27 08:32:37
第一个问题的话 其实 形成G-四链体的可能性会很大啊我觉得

因为K离子 跟 G-四链体的 亲和力是很大的

互补配对的话 好像如果你的体系中也存在 Mg离子之类的 就有助于它形成双链 共存我觉得你要看序列了

第二 对于能不能打开碱基对 我觉得你可能这个需要通过NMR的方法来测试
在一维的氢谱中
10-12 ppm 的位移是 G-四链体的Hoosteen 氢键 而12-14 ppm 是双链

你可以通过核磁共振的方法去看看 那些峰还有没有。。。
2楼2013-04-27 00:26:13
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