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O天琊O银虫 (小有名气)
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有关G-四聚体/G-四分体的问题
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请教各位大神，一个颈环结构的DNA，颈上有8个或9个碱基，环上有15个；环上的这15个碱基能够形成G-四聚体结构，现在我有几个个问题： 1）在含有K离子的溶液中将该DNA热变性后缓慢降温，DNA是容易形成颈环结构还是G-四分体的构象？在这个分子中，颈的互补配对的碱基对，与环的G-四分体能不能同时存在？ 2）倘若环上的15个碱基形成G-四分体构象，那么能不能将颈上的8个或9个碱基打开？我看的有文献说G-四分体其实是依赖于G之间的氢键作用，那么是不是打不开颈上的碱基对呢？ |
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porphybaby
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【答案】应助回帖
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O天琊O(myprayer代发): 金币+2, 赠人玫瑰手有余香，鼓励应助，分子生物版块期待你的更多精彩。同样期待你更详细的应助指导。 2013-04-27 08:32:37
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第一个问题的话 其实 形成G-四链体的可能性会很大啊我觉得 因为K离子 跟 G-四链体的 亲和力是很大的 互补配对的话 好像如果你的体系中也存在 Mg离子之类的 就有助于它形成双链 共存我觉得你要看序列了 第二 对于能不能打开碱基对 我觉得你可能这个需要通过NMR的方法来测试 在一维的氢谱中 10-12 ppm 的位移是 G-四链体的Hoosteen 氢键 而12-14 ppm 是双链 你可以通过核磁共振的方法去看看 那些峰还有没有。。。 |
2楼2013-04-27 00:26:13
O天琊O
银虫 (小有名气)
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3楼2013-04-28 08:19:28
