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见神一笑

木虫 (著名写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by shelly9018 at 2013-04-26 21:55:00
这样来表述吧,我要看细菌群落的动态变化,想看群落里面有没有具有特征性变化的种群,所以想要寻找一种能够在一定标准上进行横向比较的定量方式,不知道表述的清不清楚...

寻找一种能够一定标准上进行横向比较的定量方式?没大看明白,楼主能说得具体一点么,或者举个例子也行。
好好努力
11楼2013-04-27 08:28:56
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shelly9018

新虫 (小有名气)

引用回帖:
11楼: Originally posted by 见神一笑 at 2013-04-27 08:28:56
寻找一种能够一定标准上进行横向比较的定量方式?没大看明白,楼主能说得具体一点么,或者举个例子也行。...

就是不同样本之间同一种类群的量怎样做才能进行比较
12楼2013-04-27 08:48:26
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见神一笑

木虫 (著名写手)

引用回帖:
12楼: Originally posted by shelly9018 at 2013-04-27 08:48:26
就是不同样本之间同一种类群的量怎样做才能进行比较...

用16S rRNA文库可以做到半定量。
好好努力
13楼2013-04-27 13:03:20
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shelly9018

新虫 (小有名气)

引用回帖:
13楼: Originally posted by 见神一笑 at 2013-04-27 13:03:20
用16S rRNA文库可以做到半定量。...

哦,谢谢
14楼2013-04-27 15:18:49
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璐水儿

新虫 (初入文坛)


你好!看见是两年前的贴子了,但是还是想试着问问。我现在的实验思路有点类似你的,想看看污泥中的微生物类型的变化。不知道你后来是怎么处理这个问题了?谢谢!
15楼2015-03-09 15:41:07
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南大微生物

捐助贵宾 (小有名气)


【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by shelly9018 at 2013-04-26 21:55:00
这样来表述吧,我要看细菌群落的动态变化,想看群落里面有没有具有特征性变化的种群,所以想要寻找一种能够在一定标准上进行横向比较的定量方式,不知道表述的清不清楚...

做Mi-seq貌似可以看出来
16楼2015-03-10 14:56:37
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南大微生物

捐助贵宾 (小有名气)


【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by shelly9018 at 2013-04-26 21:55:00
这样来表述吧,我要看细菌群落的动态变化,想看群落里面有没有具有特征性变化的种群,所以想要寻找一种能够在一定标准上进行横向比较的定量方式,不知道表述的清不清楚...

做Mi-seq可以看细菌群落的动态变化吧
17楼2015-03-10 14:58:10
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tomjena2015

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你师姐说的并不完全对。 根据你的情况目前比较可行的还是做DGGE。
你可以不同时间点采样,把样品冻在-80度冰箱里。 等所有的样品都采集完毕后,再同时提取所有样品的DNA,尽量不人为添加分析误差。然后同时跑DGGE。 跑完先照胶图,把数据存到QUANTITY ONE 里备用。 然后观察你的胶,找到在水平位置到随时间有变化的条带, 切胶回收,PCR, 测序, BLAST, 如果是一个SPECIES,那么你的问题就解决了,但是如果不是同一个SPECIES,那么这个方法就不行了,总之有50%的成功机率,你可以试试。
18楼2015-03-11 02:36:18
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