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shelly9018

新虫 (小有名气)

[求助] 那种分子手段可以表征微生物群落结构中每个类群相对量的动态变化? 已有2人参与

如题,那种分子手段可以表征微生物群落结构中每个类群相对量的动态变化?实验室一般是用DGGE来分析微生物的群落结构变化的,但是师姐说只能根据条带的有无看存在哪些类群,但是每个泳道的横向比较则没有什么意义,即使上样量一样,也只能作为一个判断,不能作为定量的数据来分析这个类群在整个实验分析中的动态变化,我是做湖泊底泥中的微生物生态的,想要定量一点的数据看能是否一些特殊的类群变化与一些物质产生的关系相关,所以恳请各位大侠帮帮忙,我需要用什么技术手段更好!!!!
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tomjena2015

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你师姐说的并不完全对。 根据你的情况目前比较可行的还是做DGGE。
你可以不同时间点采样,把样品冻在-80度冰箱里。 等所有的样品都采集完毕后,再同时提取所有样品的DNA,尽量不人为添加分析误差。然后同时跑DGGE。 跑完先照胶图,把数据存到QUANTITY ONE 里备用。 然后观察你的胶,找到在水平位置到随时间有变化的条带, 切胶回收,PCR, 测序, BLAST, 如果是一个SPECIES,那么你的问题就解决了,但是如果不是同一个SPECIES,那么这个方法就不行了,总之有50%的成功机率,你可以试试。
18楼2015-03-11 02:36:18
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