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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 资源 » 求助关于初学者研究蛋白质模拟的问题
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smy897579

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by shengxiang at 2013-05-02 10:25:05
看了下帖子，已经有人回复你了，其实最简单的就是用Gaussian来计算催化机理，但是那位同学说的ONIOM方法吧，确实对于研究机理是个不错的选择，不过你是做实验的，再去学习这个似乎有点麻烦，因为你的是以实验为主， ...

谢谢，很感谢你考虑到我是以实验为主的，对于分子模拟实在是力不从心，希望你能再给我一些引导，cluster models是个软件吗？能否给我一份我需要用到的软件和使用说明之类呢，谢谢。
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11楼2013-05-07 10:57:34
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shengxiang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你可以搜一点文献看看，就是利用高斯计算酶催化机理的，cluster model指的是只选取活性中心进行计算的意思。 给你几篇文献你看看吧~
Biochemistry,2011,50,1505;
J. Am. Chem. Soc. 134, 5817-5831.
Angew. Chem. Int. Ed. 52, 4563-4567
Chem. Eur. J. 17, 704-713
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12楼2013-05-11 10:52:39
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shengxiang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

Biochemistry,2011,50,1505;
J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 5817-5831.
Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 4563-4567
Chem. Eur. J. 2011,17, 704-713
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13楼2013-05-11 10:53:30
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smy897579

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by shengxiang at 2013-05-11 10:53:30
Biochemistry,2011,50,1505;
J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 5817-5831.
Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 4563-4567
Chem. Eur. J. 2011,17, 704-713

麻烦你，能把这几篇文章发到我的邮箱里吗？smy897579@163.com谢谢
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14楼2013-07-23 21:38:54
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