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justrightnow

铜虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 120.5
散金: 2
帖子: 78
在线: 17.4小时
虫号: 1658062
注册: 2012-03-02
性别: GG
专业: 生物防治

[交流] 求问各位大神，有没有快速批量比对16S或ITS序列的软件或方法？已有5人参与

家好，我是做松材线虫病防治方面的，主要在环境中寻找分离该病害相关的微生物，现在用纯培养法分离到了很多微生物，纯化后对它们进行了测序，细菌16S；真菌ITS1和4，
现在要去比对这些序列，目前我用的方法是挨个比对，公司给的测序结果中的seq文件，用记事本打开，然后将内容复制到NCBI——blast中
这样粘贴过去后会有换行，还要挨个删除，好麻烦好浪费时间，，，
求问各位大神，有没有快速批量比对16S或ITS序列的软件或方法？

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一心一意持续镇定关注

1楼 2013-04-25 14:33:31

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

wwmei

银虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 341.1
红花: 1
帖子: 13
在线: 169.7小时
虫号: 809785
注册: 2009-07-16

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

choromas 可以直接打开，或者NCBI直接可以上载

2楼2013-04-25 19:24:41

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