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龙山狮崖铁杆木虫 (正式写手)
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晶体坐标变换问题
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| 有一个晶体，晶胞三个方向的晶格长度分别为a，b，c，我想将晶体的前两个方向变一下，也就是晶格长度变为b，a，c，请问晶体内的各个原子坐标该如何变化？用那些软件能办到？谢谢！ |
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龙山狮崖
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【答案】应助回帖
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龙山狮崖: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢！ 2013-05-12 20:38:32
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用线性代数里的坐标变换方法。 写出新的基矢在旧基矢下面的转换矩阵，然后用每个原子对应的位置矢量乘以这个矩阵。这样虽然麻烦点，但是却是万能的。这个脚本可以用matlab来写。 设原来的基矢是v1,v2,v3，新基矢是u1,u2,u3，某个原子在旧基矢下的分量表示成[v|a]，对应的新基矢下的分量是[u|a]，这个转换关系写成矩阵式就是[u|a] = [u|v]*[v|a]。[u|v]就是基组v在基组u下的表示矩阵。 例如v1 = 1 * u1 + 2 * u2 + 3 * u3，转换矩阵的第一列就是transpose([1,2,3])。注意这里是列矢量而不是行矢量，转换的时候原子坐标也是列矢量。 |
3楼2013-05-12 19:17:45
