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shelly9018新虫 (小有名气)
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可以用什么分子技术,分析环境中微生物群体的数量啊,如底泥的微生物数量的变化 已有5人参与
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| 如题,想做底泥中细菌数量的变化,能够用什么分子技术来实行比较好的定量呢,是不是RT-PCR可以呢,那它是怎样做的,也是针对16rRNA基因的数量拷贝来分析的嘛?望大家提供宝贵意见和经验! |
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kiruwa
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4楼2013-04-24 21:09:23
2楼2013-04-24 18:58:44
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
laozuzunzhe: 金币+5, good! 2013-04-24 21:11:16
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
laozuzunzhe: 金币+5, good! 2013-04-24 21:11:16
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可以通过绝对定量PCR,即RT-PCR进行定量检测,不过做之前要制备对应检测基因的标准品 另一种做法是半定量法,将对应基因缺失一部分制成内标,制备成不同梯度的内标样品,将土壤DNA和不同浓度内标样品混合,PCR扩增目的基因,比较2个模板竞争性PCR产物的亮弱,亮度相同的结果即可定量待测土壤中微生物的量。 16S rRNA基因定量结果不是最终的微生物数量,需要除以3.4,因为不同微生物16S rRNA基因的拷贝数不同,平均值在3.4左右。 |
3楼2013-04-24 19:50:46
kiruwa
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5楼2013-04-24 21:10:14










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