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linxi_mengg木虫 (著名写手)
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[求助]
如何将ins, del和inversion的序列锚定到已知的基因组序列上？
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背景1：手上有大批的经测序获得的基因组某一scafold上的插入(ins)，缺失(del)位点，序列信息； 背景2：基因组序列和相应的scafold序列是已知的； 背景3：该scafold上注释基因位点，序列信息等也是已知的 问题是这样的：我想做出一种图示，把这些ins,del和注释基因一并锚定到相应的基因组上，方便观察这些变异位点对基因本事或者调控序列等的影响。 各虫子有什么方法和软件可以实现这样的分析要求？ 或者有哪些分析方法可以用来分析这些变异位点对基因的影响？ |
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