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linxi_mengg木虫 (著名写手)
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[求助]
如何将ins, del和inversion的序列锚定到已知的基因组序列上?
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背景1:手上有大批的经测序获得的基因组某一scafold上的插入(ins),缺失(del)位点,序列信息; 背景2:基因组序列和相应的scafold序列是已知的; 背景3:该scafold上注释基因位点,序列信息等也是已知的 问题是这样的:我想做出一种图示,把这些ins,del和注释基因一并锚定到相应的基因组上,方便观察这些变异位点对基因本事或者调控序列等的影响。 各虫子有什么方法和软件可以实现这样的分析要求? 或者有哪些分析方法可以用来分析这些变异位点对基因的影响? |
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