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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 有哪位大虾做过DNA测序的建库嘛？如何去除DNA文库中的小片段？
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wangxin_1_2

新虫 (初入文坛)

[求助] 有哪位大虾做过DNA测序的建库嘛？如何去除DNA文库中的小片段？ 已有3人参与

有哪位大虾做过DNA测序的建库吗？我做的是500bp库，当中有一部分小片段，去除不干净，测序的结果中这种小片段反而占据了主要数据。有哪位大虾知道如何去除DNA文库中的小片段吗？
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1楼 2013-04-23 13:22:36
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shania1213

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励应助！ 2013-04-23 14:36:04
我觉得楼主可以试一下超滤管。选择合适膜孔大小超滤管，离心后小片段都被滤掉，剩下的就是你的库了。
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2楼2013-04-23 14:07:23
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匿名

用户注销 (初入文坛)
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3楼2013-06-17 13:42:35
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跳舞的骆驼

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

用磁珠纯化，XP的磁珠
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4楼2014-06-04 12:43:14
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天秤樱321

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我们公司用AMPure XP beads进行文库分选纯化，如果DNA文库插入片段大小为500-700bp，此时插入片段+接头片段大小为600-800bp，磁珠用量第一次选择0.2X，第二次选择0.15X，X表示样本DNA体积。
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最大的敌人是自己
5楼2018-05-10 16:25:41
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jj1292

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

磁珠纯化啊...我们用的全式金的DNA Purification Beads 80%乙醇洗两遍，然后用水洗脱下来。
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6楼2018-05-17 13:21:01
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