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wangxin_1_2

新虫 (初入文坛)

[求助] 有哪位大虾做过DNA测序的建库嘛?如何去除DNA文库中的小片段? 已有3人参与

有哪位大虾做过DNA测序的建库吗?我做的是500bp库,当中有一部分小片段,去除不干净,测序的结果中这种小片段反而占据了主要数据。有哪位大虾知道如何去除DNA文库中的小片段吗?
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shania1213

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励应助! 2013-04-23 14:36:04
我觉得楼主可以试一下超滤管。选择合适膜孔大小超滤管,离心后小片段都被滤掉,剩下的就是你的库了。
2楼2013-04-23 14:07:23
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匿名

用户注销 (初入文坛)

本帖仅楼主可见
3楼2013-06-17 13:42:35
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跳舞的骆驼

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

用磁珠纯化,XP的磁珠
4楼2014-06-04 12:43:14
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天秤樱321

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我们公司用AMPure XP beads进行文库分选纯化,如果DNA文库插入片段大小为500-700bp,此时插入片段+接头片段大小为600-800bp,磁珠用量第一次选择0.2X,第二次选择0.15X,X表示样本DNA体积。
最大的敌人是自己
5楼2018-05-10 16:25:41
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jj1292

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

磁珠纯化啊...我们用的全式金的DNA Purification Beads 80%乙醇洗两遍,然后用水洗脱下来。
6楼2018-05-17 13:21:01
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