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高雅丽

铁虫 (初入文坛)

[求助] 肠道及口腔微生物的富集培养

本人需要从粪便和唾液中提取微生物的宏基因组,但考虑到直接提取所得较少,想要把微生物进行一下富集培养,请前辈们给点建议,不甚感激。
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做一个无可救药的乐观女子。
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zhenwuhuang

至尊木虫 (文学泰斗)

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★ ★ ★ ★
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zhangxingc: 金币+1, 欢迎常到微生物版 2013-04-22 12:49:44
高雅丽: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-04-23 09:09:48
凡纳滨对虾肠道微生物宏基因组测序初步分析及培养条件的探讨。http://cdmd.cnki.com.cn/Article/CDMD-80068-1011093858.htm
2楼2013-04-22 10:36:01
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leonn

铁杆木虫 (小有名气)

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感谢参与,应助指数 +1
高雅丽: 金币+1, 有帮助 2013-04-23 09:10:39
这两种样品提取宏基因组都不需要富集的啊 直接用试剂盒提取的量足够第二代高通量测序用的 你后续还需要做什么其他的实验吗?
3楼2013-04-22 13:29:27
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Myrainy1020

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
高雅丽: 金币+1, 有帮助 2013-04-23 09:10:12
一般提取的DNA够用了哇,不够用就多取一点样品提取,有的肠道微生物不好培养,这也是高通量测序之类的技术能解决的关键所在。
4楼2013-04-22 16:02:06
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见神一笑

木虫 (著名写手)

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感谢参与,应助指数 +1
高雅丽: 金币+1, 有帮助 2013-04-23 09:10:23
富集培养了那还能叫原样品的宏基因组么?不管是什么培养基都是有选择性的,你富集培养的过程肯定会有一些菌的DNA被稀释了,到时候可能扩增不出来
好好努力
5楼2013-04-23 08:13:18
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高雅丽

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by leonn at 2013-04-22 13:29:27
这两种样品提取宏基因组都不需要富集的啊 直接用试剂盒提取的量足够第二代高通量测序用的 你后续还需要做什么其他的实验吗?

我是要拿来酶解打质谱的,量太少了不够。
做一个无可救药的乐观女子。
6楼2013-04-23 09:08:35
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高雅丽

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 见神一笑 at 2013-04-23 08:13:18
富集培养了那还能叫原样品的宏基因组么?不管是什么培养基都是有选择性的,你富集培养的过程肯定会有一些菌的DNA被稀释了,到时候可能扩增不出来

我不扩增,只是酶解打质谱。
做一个无可救药的乐观女子。
7楼2013-04-23 09:09:24
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leonn

铁杆木虫 (小有名气)

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一般肠道微生物和口腔唾液微生物都是用BHI培养基厌氧培养
8楼2013-04-23 09:18:51
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9楼2015-03-30 14:07:56
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