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wei630

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[求助] 请问用来建构系统发生树的鲸鱼的细胞色素C的序列

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1楼 2013-04-21 00:22:01

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xiadongliang

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【答案】应助回帖

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/JN190949.1

布氏鲸

Balaenoptera edeni isolate Whale-159-Poonthura cytochrome b (Cytb) gene, partial cds; mitochondrial
GenBank: JN190949.1
FASTA Graphics
Go to:
LOCUS    JN190949                421 bp DNA    linear MAM 02-AUG-2011
DEFINITION  Balaenoptera edeni isolate Whale-159-Poonthura cytochrome b (Cytb)
         gene, partial cds; mitochondrial.
ACCESSION JN190949
VERSION    JN190949.1  GI:341867077
KEYWORDS .
SOURCE    mitochondrion Balaenoptera edeni (pygmy Bryde's whale)
  ORGANISM  Balaenoptera edeni
         Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
         Mammalia; Eutheria; Laurasiatheria; Cetartiodactyla; Cetacea;
         Mysticeti; Balaenopteridae; Balaenoptera.
REFERENCE 1  (bases 1 to 421)
  AUTHORS Bijukumar,A., Jijith,S.S., Suresh Kumar,U. and Sanil,G.
  TITLE    Taxonomy of the Bryde's whale (Balaenoptera edeni Anderson)
         stranded along Kerala coast, India
  JOURNAL Unpublished
REFERENCE 2  (bases 1 to 421)
  AUTHORS Bijukumar,A., Jijith,S.S., Suresh Kumar,U. and Sanil,G.
  TITLE    Direct Submission
  JOURNAL Submitted (29-JUN-2011) Department of Aquatic Biology and
         Fisheries, University of Kerala, Karyavattom Campus, Trivandrum,
         Kerala 695581, India
FEATURES          Location/Qualifiers
   source       1..421
                  /organism="Balaenoptera edeni"
                  /organelle="mitochondrion"
                  /mol_type="genomic DNA"
                  /isolate="Whale-159-Poonthura"
                  /db_xref="taxon:9769"
   gene          <1..>421
                  /gene="Cytb"
   CDS          <1..>421
                  /gene="Cytb"
                  /codon_start=2
                  /transl_table=2
                  /product="cytochrome b"
                  /protein_id="AEK98512.1"
                  /db_xref="GI:341867078"
                  /translation="GATVITNLLSAIPYIGTTLVEWIWGGFSVDKATLTRFFAFHFIL
                  PFIILALAMVHLIFLHETGSNNPTGIPSDMDKIPFHPYYTVKDILGALLLILTLLMLT
                  LFAPDLLGDPDNYTPANPLNTPAHIKPEWYFLFAYAIL"
ORIGIN
      1 aggcgcaacc gtcatcacca acctcttatc agcaatccca tacattggta ctaccctagt
   61 cgaatggatc tgaggcggct tctctgtaga taaagcaaca ttaactcgct tttttgcctt
   121 ccactttatt ctccccttca ttattctagc actagcaata gtccacctca ttttcctcca
   181 cgaaacagga tccaacaacc ccacaggtat tccatccgac atagacaaaa tcccattcca
   241 cccctactac acagttaaag acattctagg cgccctacta ctaatcctaa ccctactaat
   301 actaacccta ttcgcacccg acctgcttgg agacccagac aactacactc cagcaaatcc
   361 actcaatacc ccagcacaca ttaaaccaga atgatatttc ctatttgcat acgcaatcct
   421 a
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