| 查看: 3746 | 回复: 14 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
关于uniprot的批量序列下载
|
||
|
我想从uniprot上批量下载400多个kinase的protein kinase domain，手工操作太麻烦且容易出错，网站自身又没有批处理功能，怎样能够实现这样的程序化批量下载呢？是不是要编写什么网页脚本？求大神指教！如回答的好我会继续加金币的！ [ 来自科研家族 化学生物学 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
现代”学阀”该如何界定
已经有12人回复
-
国社科系统bug了，是不是要放榜了？
已经有10人回复
-
课题组招2027级博士 上海工程技术大学 激光智能制造方向
已经有4人回复
-
上海工程技术大学 激光智能制造课题组 2027级博士研究生招生
已经有3人回复
-
上海工程技术大学激光智能制造课题组｜2027级博士研究生招生公告
已经有11人回复
-
我的奶奶
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 从uniprot中下载的氨基酸序列的fasta格式中的PE,SV分别指什么
已经有4人回复
- 【求助/交流】求助：如何能在genbank中快速批量下载序列
已经有6人回复
帘外飞雪
银虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1146.9
- 散金: 50
- 红花: 4
- 帖子: 132
- 在线: 391.8小时
- 虫号: 2289319
- 注册: 2013-02-20
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
8楼2013-04-21 10:22:15
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, BLAST也是个可行的思路 2013-04-20 08:21:40
ValYu: 金币+5, ★有帮助 2013-04-21 09:20:25
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, BLAST也是个可行的思路 2013-04-20 08:21:40
ValYu: 金币+5, ★有帮助 2013-04-21 09:20:25
|
坐等高手。 如果是我，会选择做BLAST，把blast结果下载，其中的fasta格式基本满足我的需要，想需要多的序列，BLAST的时候先设置一下参数。可以参考刚做的结果： http://www.uniprot.org/blast/uniprot/201304196009B639SI.* 或 http://www.uniprot.org/blast/uni ... e=yes&limit=250 |
2楼2013-04-19 21:54:23
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- BioEPI: 18
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 1.818
- 金币: 24652.2
- 散金: 197
- 红花: 48
- 沙发: 2
- 帖子: 2254
- 在线: 400.7小时
- 虫号: 1879241
- 注册: 2012-07-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
3楼2013-04-20 08:20:25
帘外飞雪
银虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1146.9
- 散金: 50
- 红花: 4
- 帖子: 132
- 在线: 391.8小时
- 虫号: 2289319
- 注册: 2013-02-20
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
4楼2013-04-20 19:49:15