24小时热门版块排行榜    

查看: 1918  |  回复: 22

ultraq

至尊木虫 (著名写手)


[交流] 有人了解fullprof的键长约束吗?

最近用Fullprof做一个氧化物的拟合,发现一个键长太小,审稿人建议做键长约束,不知道哪位高手知道怎么做?我自己搞了半个月也没搞定
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

FullProf

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

大堂9999

金虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
ultraq: 金币+3, 谢谢帮顶 2013-04-21 11:15:36
没听说过键长约束,帮顶
2楼2013-04-19 14:11:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kuoli2010

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
ultraq: 金币+5, 谢谢回复 2013-04-21 11:15:26
updayday: 金币+1, 感谢您的参与 2013-05-19 21:38:24
在editpcr里面constraint/restraint里面找。
3楼2013-04-21 02:34:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ultraq

至尊木虫 (著名写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by kuoli2010 at 2013-04-21 02:34:11
在editpcr里面constraint/restraint里面找。

谢谢,但我不知道怎么选择atom 2的Rotation symmetry,即如何选(x,y,z)还是其它?另外,还有translate vector?我找了manual上说有一个叫DCONSTR的文件会被创建当dis=3的时候,但我一直没找到这个文件
4楼2013-04-21 11:14:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenwuhuang

至尊木虫 (文学泰斗)


★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
updayday: 金币+1, 感谢您的参与 2013-05-19 21:38:34
XRD图的 Rietveld全谱拟合问题(fullprof程序)。http://muchong.com/html/201004/1935421.html
6楼2013-04-21 11:27:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiedt

金虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
祝一切顺利,祝多发SCI,TRANS,……
7楼2013-04-21 11:59:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsq918

银虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
在editpcr里面constraint/restraint里面找。
8楼2013-04-21 12:23:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ultraq

至尊木虫 (著名写手)


现在灌水的人怎么这么多?
10楼2013-04-21 12:58:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

哈哈大姑爷

至尊木虫 (知名作家)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
在editpcr里面constraint/restraint里面找。
11楼2013-04-21 13:28:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kuoli2010

木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by ultraq at 2013-04-20 22:14:03
谢谢,但我不知道怎么选择atom 2的Rotation symmetry,即如何选(x,y,z)还是其它?另外,还有translate vector?我找了manual上说有一个叫DCONSTR的文件会被创建当dis=3的时候,但我一直没找到这个文件...

不好意思我也没做过。试试找吧。我学fullprof基本都是自己摸出来的,但是现在基本都用JANA。。。
12楼2013-04-22 02:48:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gzl9901

铁杆木虫 (文坛精英)


祝福!祝福!一切顺利!
13楼2013-04-22 03:17:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ultraq

至尊木虫 (著名写手)


引用回帖:
12楼: Originally posted by kuoli2010 at 2013-04-22 02:48:50
不好意思我也没做过。试试找吧。我学fullprof基本都是自己摸出来的,但是现在基本都用JANA。。。...

谢谢,看样子是找不到人啦
14楼2013-04-22 07:49:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ultraq

至尊木虫 (著名写手)


引用回帖:
12楼: Originally posted by kuoli2010 at 2013-04-22 02:48:50
不好意思我也没做过。试试找吧。我学fullprof基本都是自己摸出来的,但是现在基本都用JANA。。。...

Jana好用吗?我也试图学过一段Jana,总是弄不懂啊
15楼2013-04-22 07:50:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kuoli2010

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
ultraq: 金币+5, 谢谢! 2013-04-24 15:03:51
updayday: 金币+1, 感谢您的参与 2013-05-19 21:39:09
引用回帖:
15楼: Originally posted by ultraq at 2013-04-21 18:50:53
Jana好用吗?我也试图学过一段Jana,总是弄不懂啊...

这个其实很细节了。我觉得国内除了专门做这个老师之外,学生做到这步的应该不多。而老师们上这来的不多……JANA比Fullprof好的是不挑数据,收敛性好,更新速度快,更适合做非公度相,有一些很独到的特点,比如非谐结构因子。当然现在还赶不上Fullprof牛,Fullprof的摊子铺得太大,啥都往里搞。
16楼2013-04-23 11:09:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ultraq

至尊木虫 (著名写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by ultraq at 2013-04-21 11:14:03
谢谢,但我不知道怎么选择atom 2的Rotation symmetry,即如何选(x,y,z)还是其它?另外,还有translate vector?我找了manual上说有一个叫DCONSTR的文件会被创建当dis=3的时候,但我一直没找到这个文件...

今天无意中发现一个叫CFML_Restraints_1.tpcr的文件,就应该是在manual上说的DOCONSTR的文件,但悲剧的是把约束放上去好像没用,程序在加约束和没加约束结果一样
17楼2013-05-07 08:07:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ultraq

至尊木虫 (著名写手)


前几天用GSAS作了约束,仍然无效
18楼2013-05-19 10:14:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
ultraq: 金币+5, 谢谢,不过你应该做有机的吧,好像是有区别的 2013-05-19 12:25:13
updayday: 金币+1, 感谢您的参与 2013-05-19 21:39:20
一般只是约束最长的,也就是在这个范围之内的算成键。太短的需要人为排除,比如两个Cl离子,之间距离不可能小于离子半径的二倍(当然略小一些也是正常的)。也需要区分大半径和小半径的原子。
19楼2013-05-19 12:08:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daxu

铁杆木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
ultraq: 金币+5, 谢谢! 2013-05-19 18:35:57
updayday: 金币+1, 感谢您的参与 2013-05-19 21:39:30
建议你搜搜论坛里有关fullprof的帖子,我记得回帖里我提过
20楼2013-05-19 12:40:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daxu

铁杆木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
ultraq: 金币+5, 收到!是不是这个约束只有在做simulated annealing才有效?你做过吗?谢谢! 2013-05-19 18:37:07
lijunjie84: 金币+50, 代发bb 2013-05-22 14:50:09
lijunjie84: 金币+22 2013-05-22 14:50:14
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5347362
我搜了一下,这个帖子里有,另外在求助前最好能搜搜,好多网上都能找到答案
21楼2013-05-19 12:49:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ultraq

至尊木虫 (著名写手)


引用回帖:
21楼: Originally posted by daxu at 2013-05-19 12:49:59
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5347362
我搜了一下,这个帖子里有,另外在求助前最好能搜搜,好多网上都能找到答案

感谢daxu老师的帮助,终于把问题解决了
关键问题是要把.tpcr文件中约束的键长直接拷贝到pcr内才有效。
22楼2013-05-22 11:35:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daxu

铁杆木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
22楼: Originally posted by ultraq at 2013-05-22 11:35:50
感谢daxu老师的帮助,终于把问题解决了
关键问题是要把.tpcr文件中约束的键长直接拷贝到pcr内才有效。...

不是,是Sr1原子的Z坐标没有精修。另外,建议再把精修润色一下,我感觉精修的结果可能还能提高
23楼2013-05-22 16:48:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
xiaoyu9275楼
2013-04-21 11:25   回复  
祝福
wangkj9楼
2013-04-21 12:43   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 ultraq 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见