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emanlee木虫 (小有名气)
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[求助]
请问如何知道RNA-Seq读段是否包含adapter接头
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如何知道RNA-Seq读段是否包含adaptor？ （1）从 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRX025783 下载了NCBI sra的数据，不知道该数据是否已经去除了adaptor？ （2）是不是默认情况下，NCBI sra的数据都没有adaptor？ （3）从sra的读段数据就可以判断是否包含adaptor？比如所有读段在两端或一段包含相同的碱基，就认为这些是adaptor？ [ Last edited by emanlee on 2013-4-18 at 08:46 ] |
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