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emanlee管理员
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[求助]
请问如何知道RNA-Seq读段是否包含adapter接头
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如何知道RNA-Seq读段是否包含adaptor? (1)从 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRX025783 下载了NCBI sra的数据,不知道该数据是否已经去除了adaptor? (2)是不是默认情况下,NCBI sra的数据都没有adaptor? (3)从sra的读段数据就可以判断是否包含adaptor?比如所有读段在两端或一段包含相同的碱基,就认为这些是adaptor? [ Last edited by emanlee on 2013-4-18 at 08:46 ] |
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yinzhangqian
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