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Bella0224

金虫 (小有名气)

[求助] 毛状根PCR检测无条带

各位虫友,最近用微量DNA提取毛状根基因组,浓度检测为0.177微克/微升,260/280=1.44

之后进行PCR检测:
阳性对照   Ri质粒(来源于A4)
阴性对照   植物基因组DNA
模板   毛状根DNA
空白对照

PCR条件:
rolC 基因(624bp)的引物:5’-CTCCTGACATCAAACTCGTC-3’, 5’-TGCTTCGAGTTATGGGTACA-3’,
(1)条件:94℃,5min;94℃,40s:55℃,40s:72℃,1min,35个循环;72℃,8min
(2)94℃,3min;94℃,1min:53.5℃,1min:72℃,1min,35个循环;72℃,10min

rolB 基因(423bp)的引物: 5’-GCTCTTGCAGTGCTAGATTT-3’, 5’-GAAGGTGCAAGCTACCTCTC-3’,
条件:94℃,3min;94℃,50s:56℃,45s:72℃,1min,34个循环;72℃,10min

PCR结果跑1%电泳,除了marker2000其他的都木有。。。。。。。

很奇怪连阳性对照都木有,我的引物是按参考文献走的,是不是不是所有的Ri质粒都相同?所以这个引物不适合A4呢?

我的PCR条件是否退火温度太高呢?我之后应该怎么办呢?求助各位啊。。。。
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