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奔跑的乌拉龟

铜虫 (正式写手)

[求助] 实验问题求助,关于可变剪切的

用RACE-PCR技术克隆出某个物种还没有报道过基因的ORF段全长,找到poly(A)尾和起始密码子,在NCBI上比对已知类似基因的序列也对,但两个单克隆测序结果发现某个单克隆中间缺少81个碱基,重新做T载体连接,转化测序依旧是缺少81个碱基,所以怀疑是可变剪切。本人刚读研,想问一下前辈们,如果想继续做下去该怎么做?仅仅是验证两个基因的功能就没有其他可做的了吗?可能这方面文献读的太少,几乎空白,如果想发一个小paper,该怎么做有点创新性呢?谢谢大家了!
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脚踏实地
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ck8148

金虫 (初入文坛)

可以再DNA中将这个基因扩增出来,一般可变剪切的概率较小,看看DNA中是否有这段区域,分析一下所包含的内含子,就基本可以确定是否为可变剪切,如果在DNA序列中就不存在这81bp,也就没有可变剪切的可能性了
3楼2013-04-11 17:02:30
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