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奔跑的乌拉龟

铜虫 (正式写手)

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[求助] 实验问题求助，关于可变剪切的

用RACE-PCR技术克隆出某个物种还没有报道过基因的ORF段全长，找到poly(A)尾和起始密码子，在NCBI上比对已知类似基因的序列也对，但两个单克隆测序结果发现某个单克隆中间缺少81个碱基，重新做T载体连接，转化测序依旧是缺少81个碱基，所以怀疑是可变剪切。本人刚读研，想问一下前辈们，如果想继续做下去该怎么做？仅仅是验证两个基因的功能就没有其他可做的了吗？可能这方面文献读的太少，几乎空白，如果想发一个小paper，该怎么做有点创新性呢？谢谢大家了!

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脚踏实地

1楼 2013-04-09 22:16:12

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ck8148

金虫 (初入文坛)

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可以再DNA中将这个基因扩增出来，一般可变剪切的概率较小，看看DNA中是否有这段区域，分析一下所包含的内含子，就基本可以确定是否为可变剪切，如果在DNA序列中就不存在这81bp，也就没有可变剪切的可能性了

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3楼2013-04-11 17:02:30

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