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如何在CIF中添加氢键及其对称码？
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#D H A D - H H...A D...A D - H...A symm(A) # C7 H7A S3 0.9699 2.8066 3.629(3) 143.02 4_455 yes C10 H10B S3 0.9698 2.8362 3.750(3) 157.42 1_455 yes 我把以上氢键内容加入到CIF中后发现A级错误，需要核对纠正对称码，内容如下： -------------- PLAT707 PLAT707 Type_1 Test for consistency of H-Bond D..A Distances and Coordinates in CIF This ALERT is generally related to incorrect symmetry codes. The symmetry number s in the symmetry code s_pqr should correspond to the expression for s in the CIF. Those expressions can be different for different software packages. E.g. pasting H-bond table data generated with PLATON into a CIF generated with SHELXL may raise this ALERT. Manual correction of the symmetry code should be trivial. ----------------------------- 请问对称码应该加在什么位置，如何加，时间紧，我又太菜，好心朋友从上一个帖子找到CIF帮我加好20金币全部奉送。 [ Last edited by 小木虫2007 on 2007-9-13 at 19:26 ] |
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4楼2007-09-12 11:41:22
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seasedoctor(金币+5,VIP+0):同样感谢你。请继续支持晶体版。谢谢。
seasedoctor(金币+5,VIP+0):同样感谢你。请继续支持晶体版。谢谢。
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你可以用platon 打开cif 然后calc H bond 可令 就出现对称吗了 呵呵 如果有问题 可以email给我 乐于效劳 呵呵 210309008@suda.edu.cn  |
2楼2007-09-10 18:27:13
celerya
木虫 (小有名气)
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- 专业: 绿色有机化学
3楼2007-09-10 20:01:26
